35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2233 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2233  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 251 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3726  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.22 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2106  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34 
 
 		 493 aa  50.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.314279 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 635 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  29.03 
 
 		 480 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1510  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  44.44 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.360333  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0518  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.43 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2804  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.98 
 
 		 364 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0769202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 		 478 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4510  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.84 
 
 		 398 aa  45.4  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.678924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  61.76 
 
 		 450 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.57 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 482 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0066  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.73 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  41.54 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  56.41 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0971  peptidoglycan binding domain-containing protein  52.73 
 
 		 356 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3167  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.62 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00456711  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.33 
 
 		 667 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2694  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.78 
 
 		 315 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0052  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.91 
 
 		 346 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.246037  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.66 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.86 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  42.25 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0539  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.06 
 
 		 464 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  41.27 
 
 		 438 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.55 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  25.81 
 
 		 478 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  25.81 
 
 		 478 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  25.81 
 
 		 478 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.25 
 
 		 323 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1246  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.83 
 
 		 508 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.1 
 
 		 417 aa  42.4  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2792  hypothetical protein  42.03 
 
 		 264 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  35.24 
 
 		 276 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>