More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0749 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
514 aa  1027    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.13217  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
460 aa  350  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.934772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
455 aa  344  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.803977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.4 
 
 
293 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3958  putative sugar transporter, permease protein  45.65 
 
 
300 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  0.0364521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.31 
 
 
279 aa  160  5e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
271 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
275 aa  160  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  41.2 
 
 
276 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
311 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
295 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  37.64 
 
 
269 aa  156  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
271 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  43.2 
 
 
271 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.29 
 
 
279 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
280 aa  155  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
297 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.714989  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5710  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  40.48 
 
 
280 aa  154  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.249557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
298 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
287 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0110581  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
287 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.51 
 
 
291 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
275 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
285 aa  150  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
308 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  41.75 
 
 
275 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
288 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.52 
 
 
279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.6 
 
 
305 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
301 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.19 
 
 
273 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  36.91 
 
 
277 aa  148  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
294 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
278 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  41.06 
 
 
281 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
290 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  37.5 
 
 
276 aa  147  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
271 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
295 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
275 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
274 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
270 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
272 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.36 
 
 
302 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
270 aa  144  4e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  40.67 
 
 
287 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.91 
 
 
280 aa  144  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 
297 aa  144  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
284 aa  144  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
294 aa  144  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
300 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.852647  hitchhiker  0.00315678 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  36 
 
 
277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  36 
 
 
277 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  39.48 
 
 
263 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
289 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  38.2 
 
 
273 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
300 aa  141  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339227  normal  0.298734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
292 aa  140  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
283 aa  140  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.19 
 
 
306 aa  140  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
304 aa  140  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
298 aa  140  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3840  permease protein of sugar ABC transporter  40.09 
 
 
257 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0859974  normal  0.0349833 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
352 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273783  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
281 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302413  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  36.48 
 
 
278 aa  139  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
406 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.54 
 
 
296 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  34.51 
 
 
308 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
282 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  35.32 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.44 
 
 
350 aa  138  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
304 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
278 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
308 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
302 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.61 
 
 
295 aa  137  5e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
268 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
277 aa  137  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
324 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
284 aa  136  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
276 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1938  putative permease protein of sugar ABC transporter  39.48 
 
 
274 aa  136  8e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
286 aa  136  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.78 
 
 
274 aa  136  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
307 aa  136  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.9 
 
 
304 aa  136  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06320  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.18 
 
 
298 aa  136  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.27 
 
 
278 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5004  sugar ABC transporter permease  36.48 
 
 
316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0638088  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  35.43 
 
 
280 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  39.74 
 
 
295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
287 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.091777  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
315 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>