More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5082 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  94.54 
 
 
352 aa  662    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273783  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
348 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339227  normal  0.298734 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  84.48 
 
 
350 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.77 
 
 
350 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.48 
 
 
350 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12913  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.91 
 
 
349 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3521  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.19 
 
 
349 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.6 
 
 
349 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59414  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.31 
 
 
349 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.470539 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.2 
 
 
478 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.49 
 
 
275 aa  232  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
315 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
267 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  40.37 
 
 
277 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
288 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
301 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
300 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
277 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0514  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
272 aa  179  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  42.01 
 
 
281 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.68 
 
 
277 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.09 
 
 
302 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
290 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
315 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
270 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  43.84 
 
 
273 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.14 
 
 
275 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
283 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
281 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.73 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  41.51 
 
 
278 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  36.59 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.64 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
271 aa  172  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
324 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.23 
 
 
381 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  38.64 
 
 
306 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
270 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
299 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
294 aa  169  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
310 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 
701 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.36 
 
 
279 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.61 
 
 
274 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
280 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  42.15 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  39.73 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
272 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
285 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.11 
 
 
295 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.9 
 
 
275 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  38.36 
 
 
271 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
271 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  41.83 
 
 
272 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
272 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  39.51 
 
 
276 aa  165  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.6 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.091777  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15080  ABC-type sugar transport system, permease component  37.9 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.316794  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.36 
 
 
722 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
319 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  39.73 
 
 
278 aa  163  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.17 
 
 
301 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  32.03 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
743 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.445152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
299 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
271 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.32 
 
 
295 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3536  putative sugar transporter, permease protein  39.34 
 
 
282 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
311 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 
280 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.697078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0338  monosaccharide-transporting ATPase  40.62 
 
 
701 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
268 aa  159  7e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
280 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
298 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.2 
 
 
275 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
293 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
299 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
297 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
300 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
299 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
304 aa  158  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
278 aa  158  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
274 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5822  putative sugar uptake ABC transporter permease protein  38.18 
 
 
298 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
279 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
275 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
274 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  37.9 
 
 
298 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>