54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5793 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5793  protein of unknown function DUF218  100 
 
 		 225 aa  466  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2090  hypothetical protein  50.83 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3988  protein of unknown function DUF218  30.52 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.672563  normal  0.593684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  36.14 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0110  putative secreted protein  24.39 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.741627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03633  hypothetical protein  29.2 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3832  protein of unknown function DUF218  28.1 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0104  putative secreted protein  24.39 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal  0.196325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0105  putative secreted protein  24.39 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0820  hypothetical protein  24.8 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0924  hypothetical protein  24.8 
 
 		 182 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0103  hypothetical protein  24.39 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.501432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3127  hypothetical protein  28.06 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.226539  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3106  hypothetical protein  27.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2858  hypothetical protein  27.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00183972  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3110  hypothetical protein  27.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2890  hypothetical protein  27.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00431016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3095  hypothetical protein  27.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.937684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2819  hypothetical protein  28.06 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3129  hypothetical protein  28.06 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00135729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2882  hypothetical protein  28.06 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0452063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2141  hypothetical protein  27.21 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1691  hypothetical protein  26.4 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0187033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2551  hypothetical protein  25.38 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1340  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  35.92 
 
 		 336 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  27.27 
 
 		 199 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1689  hypothetical protein  31.73 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.143634  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  30.77 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  27.16 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  31.33 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19840  hypothetical protein  28.28 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2067  hypothetical protein  24.64 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0351391  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2002  hypothetical protein  28.44 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.596969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  28.32 
 
 		 195 aa  45.8  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  29.63 
 
 		 251 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0237  hypothetical protein  31.87 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  31.34 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  23.15 
 
 		 264 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2167  protein of unknown function DUF218  25 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000011898 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  29.27 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13720  hypothetical protein  26.12 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.195466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  29.85 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2964  hypothetical protein  29.81 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0815547  normal  0.415025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2577  protein of unknown function DUF218  33.72 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.439933  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0110  hypothetical protein  25.24 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  33.94 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  21.2 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  29.85 
 
 		 278 aa  42.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2062  hypothetical protein  29.11 
 
 		 185 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.59257  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2278  hypothetical protein  29.11 
 
 		 185 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2304  hypothetical protein  29.11 
 
 		 185 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.195603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2124  hypothetical protein  29.11 
 
 		 185 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.564401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6227  protein of unknown function DUF218  30.71 
 
 		 420 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>