137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4060 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4060  putative phosphate ABC transporter, phosphate- binding component  100 
 
 
315 aa  643    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000141067  hitchhiker  0.000000409184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5092  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  55.63 
 
 
313 aa  329  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0839828  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7022  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  34.58 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0489  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  34.51 
 
 
307 aa  155  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4084  hypothetical protein  32.26 
 
 
301 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.694333  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2013  phosphate ABC transporter, phosphate-binding component  25.45 
 
 
302 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.097254  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  23.97 
 
 
267 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  22.62 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  22.35 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  22.03 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  21.4 
 
 
284 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  21.43 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  21.93 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  22.19 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  22.99 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.44 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  21.08 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  21.85 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  25.81 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  23.61 
 
 
285 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  19.13 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  20.69 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  20.68 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  21.24 
 
 
282 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1379  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  28.81 
 
 
327 aa  63.9  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000788807  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  21.17 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  24.07 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0584  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 
268 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  19.47 
 
 
301 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  20.99 
 
 
381 aa  62.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1605  phosphate ABC transporter (binding protein)-like protein  29.91 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00137647  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  23.74 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  22.41 
 
 
264 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  23.44 
 
 
328 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  23.74 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  22.45 
 
 
558 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  24.26 
 
 
558 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  20.66 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1338  phosphate-binding protein, putative  20.74 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  24.47 
 
 
273 aa  59.7  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  19.93 
 
 
272 aa  59.7  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  23.05 
 
 
338 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  24.62 
 
 
562 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  22.68 
 
 
270 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  22.5 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1794  phosphate-binding protein PstS-like protein  29.77 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  22.31 
 
 
218 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  20.45 
 
 
272 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  23.5 
 
 
271 aa  57  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  23.83 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  21.57 
 
 
274 aa  56.2  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  19.62 
 
 
290 aa  56.2  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  19.18 
 
 
272 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  23.04 
 
 
273 aa  55.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  22.36 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4410  phosphate binding protein  24.38 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0765558  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  27.97 
 
 
519 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  20.98 
 
 
278 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  20.65 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  21.48 
 
 
274 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  23.27 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  23.53 
 
 
299 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.6 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  24.38 
 
 
428 aa  53.9  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  21.61 
 
 
273 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  20.08 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  20.89 
 
 
298 aa  52.8  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  21.05 
 
 
270 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  21.48 
 
 
273 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  20.29 
 
 
272 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  21.83 
 
 
482 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  24.62 
 
 
460 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  23.9 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1402  hypothetical protein  23.48 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.728708 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  21.02 
 
 
272 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  19.62 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  23.48 
 
 
465 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  22.18 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  24.52 
 
 
269 aa  52.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  20.93 
 
 
279 aa  52.4  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2048  hypothetical protein  22.59 
 
 
416 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.897956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  23.18 
 
 
278 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  21.93 
 
 
284 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0612  serine/threonine protein kinase  21.67 
 
 
734 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1077  phosphate-binding protein, putative  22.5 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.626064  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  22.61 
 
 
269 aa  51.2  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3528  phosphate-binding protein  24.59 
 
 
261 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004383  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  19.64 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  19.59 
 
 
323 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  24.19 
 
 
292 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2567  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like protein  24.79 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2919  OmpA/MotB  28.12 
 
 
517 aa  48.9  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  19.79 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  21.43 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  22.54 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  23.53 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  18.53 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  23.22 
 
 
280 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  23.44 
 
 
285 aa  47  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0255  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  19.64 
 
 
325 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>