174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3859 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3859  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  100 
 
 
278 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000271699  normal  0.545193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1198  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  61.15 
 
 
278 aa  333  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2671  fumarylacetoacetase family protein  53.96 
 
 
277 aa  297  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0545  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.96 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0269  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  55.71 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2320  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.67 
 
 
291 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0314  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  53.33 
 
 
281 aa  226  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0259  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  46.79 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000269221 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4483  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.88 
 
 
288 aa  195  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0909663  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2243  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.29 
 
 
299 aa  193  2e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0481778  normal  0.293361 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0860  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.45 
 
 
294 aa  191  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4503  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.89 
 
 
290 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0128  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.02 
 
 
299 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2946  hypothetical protein  30.32 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.496966  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2836  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  30.4 
 
 
405 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46895  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  30.4 
 
 
413 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.841023  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4189  putative fumarylacetoacetate hydrolase  29.67 
 
 
400 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0232  hypothetical protein  31.72 
 
 
400 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1358  hypothetical protein  36.1 
 
 
395 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38753  normal  0.788405 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6512  hypothetical protein  30.6 
 
 
386 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3762  hypothetical protein  29.35 
 
 
389 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6099  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.04 
 
 
386 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.59157 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4663  hypothetical protein  30.15 
 
 
378 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1903  hypothetical protein  28.34 
 
 
414 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3114  hypothetical protein  28.88 
 
 
393 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4494  hypothetical protein  29.63 
 
 
378 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4300  fumarylacetoacetate hydrolase  35.29 
 
 
242 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.5 
 
 
394 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4079  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  99.4  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.545548  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5801  hypothetical protein  33.5 
 
 
394 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5802  hypothetical protein  33.01 
 
 
394 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220072  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4583  hypothetical protein  33.01 
 
 
394 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4380  hypothetical protein  33.7 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.234289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0753  hypothetical protein  29.35 
 
 
394 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.621525  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2693  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2772  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1515  hypothetical protein  28.21 
 
 
380 aa  96.3  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.43145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3693  hypothetical protein  33.65 
 
 
396 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2626  fumarylacetoacetate hydrolase  32.79 
 
 
399 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0731745 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6299  hypothetical protein  33.17 
 
 
393 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88888  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2456  hypothetical protein  30.4 
 
 
399 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000103296 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6462  hypothetical protein  33.17 
 
 
392 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6697  hypothetical protein  33.17 
 
 
392 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2826  hypothetical protein  32.97 
 
 
390 aa  93.6  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2483  hypothetical protein  28.68 
 
 
392 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.111578  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2772  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein-like protein  28.67 
 
 
391 aa  92.8  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.143778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0862  hypothetical protein  27.94 
 
 
400 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.272189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0191  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.59 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2894  hypothetical protein  33.52 
 
 
397 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201166  normal  0.112489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1141  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  32.61 
 
 
388 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0733  hypothetical protein  27.8 
 
 
392 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.328996  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4000  hypothetical protein  30.98 
 
 
383 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  32.61 
 
 
281 aa  62.8  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190133  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.2 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0140725  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2704  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.33 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2313  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  31.85 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0595  putative hydrolase  31.62 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.148841  normal  0.318998 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09031  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01490)  28.1 
 
 
295 aa  55.5  0.0000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08990  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase  27.78 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2256  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  30.6 
 
 
312 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1681  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  31.01 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07064  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07000)  30.82 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.730694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2527  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate delta-isomerase  30.68 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00539509  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0404  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  22.18 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.11849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2039  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  27.88 
 
 
305 aa  52.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.630421  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1969  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  28.42 
 
 
262 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3036  fumarylacetoacetate hydrolase domain-containing protein 2  29.85 
 
 
314 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4192  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.43 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317049  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3273  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.3 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1539  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  28.57 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1940  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  24.21 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2132  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  29.41 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0685  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  27.51 
 
 
301 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0590217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4230  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  28.99 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.270063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0556  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  28.43 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1254  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  31.16 
 
 
302 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1564  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  33.58 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2264  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  29.55 
 
 
258 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000147029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1474  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  25.25 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0595043  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4139  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  32.35 
 
 
302 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1306  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  31.62 
 
 
302 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0274  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  28.86 
 
 
258 aa  49.3  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10612  fumarylacetoacetate hydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G02370)  26.54 
 
 
288 aa  48.9  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.273012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1202  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  31.62 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1918  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  26.5 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272159  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3892  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  27.02 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.192385 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1964  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  26.5 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1898  5-oxopent-3-ene-1,2,5-tricarboxylate decarboxylase  26.5 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.41905 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0968  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  28.93 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2079  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta- isomerase  24.29 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0987  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  28.93 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141309  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1315  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconateDelta- isomerase  28.36 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.477462  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0201  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  30.32 
 
 
242 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1050  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  30.88 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0608  putative hydrolase  31.91 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.20163 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0651  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.65 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16536  normal  0.25354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6011  5-oxopent-3-ene-1,2,5- tricarboxylatedecarboxylas e  31.58 
 
 
256 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1501  5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate Delta-isomerase  27.23 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1890  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.88 
 
 
327 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1152  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  30.15 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>