19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2538 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4929  metallophosphoesterase  35.79 
 
 		 1243 aa  762    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13193  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1237 aa  722    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  32.22 
 
 		 1224 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  32.96 
 
 		 1223 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2538  metallophosphoesterase  100 
 
 		 1263 aa  2612    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  30.92 
 
 		 1222 aa  580  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11188  hypothetical protein  29.86 
 
 		 1228 aa  570  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  31.71 
 
 		 855 aa  399  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1687  hypothetical protein  31.31 
 
 		 844 aa  393  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.271034  normal  0.603971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  29.61 
 
 		 870 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  29.35 
 
 		 913 aa  351  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  29.94 
 
 		 913 aa  343  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  29.47 
 
 		 917 aa  335  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  29.53 
 
 		 913 aa  317  9.999999999999999e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  28.79 
 
 		 925 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  28.82 
 
 		 886 aa  303  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  31.93 
 
 		 665 aa  47.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5806  metallophosphoesterase  27.5 
 
 		 521 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.737004  normal  0.176893 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2616  surface antigen (D15)  26.98 
 
 		 674 aa  47.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.69192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>