More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0544 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  100 
 
 
291 aa  595  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  65.89 
 
 
301 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  61.24 
 
 
309 aa  355  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  60.87 
 
 
299 aa  344  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  61.79 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2374  chaperone DnaJ domain-containing protein  62.46 
 
 
306 aa  333  2e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.641958  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  59.59 
 
 
293 aa  322  4e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.78 
 
 
289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.79 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  41.61 
 
 
287 aa  226  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.91 
 
 
315 aa  225  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  39.54 
 
 
311 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.71 
 
 
324 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.58 
 
 
334 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  42.77 
 
 
331 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  42.67 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  38.72 
 
 
330 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.58 
 
 
319 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  37.94 
 
 
341 aa  202  5e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  37.94 
 
 
313 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  35.51 
 
 
324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  39.68 
 
 
313 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.51 
 
 
330 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.44 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  39.54 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4640  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.85 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  39.44 
 
 
330 aa  195  7e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  36.98 
 
 
302 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  39.37 
 
 
315 aa  193  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  39.6 
 
 
297 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  39.6 
 
 
297 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  39.44 
 
 
330 aa  191  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  34.5 
 
 
313 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  34.6 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.91 
 
 
316 aa  189  5e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  37.25 
 
 
306 aa  188  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0185  chaperone DnaJ domain protein  40.65 
 
 
314 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.522529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  36.93 
 
 
306 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  35.78 
 
 
335 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  36.6 
 
 
306 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  36.6 
 
 
306 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  36.6 
 
 
306 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  36.6 
 
 
306 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  36.6 
 
 
306 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  36.6 
 
 
306 aa  186  5e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.46 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6429  chaperone DnaJ domain protein  35.24 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.480227 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  40.34 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  36.27 
 
 
306 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  35.4 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.38 
 
 
315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  35.14 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  38.24 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.73 
 
 
315 aa  182  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.81 
 
 
297 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  39.93 
 
 
298 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  34.64 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  34.64 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  34.64 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  34.64 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  34.64 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  39.93 
 
 
299 aa  181  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  34.24 
 
 
335 aa  180  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  33.61 
 
 
375 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  35.96 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1382  heat shock protein DnaJ-like  39.41 
 
 
313 aa  179  7e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  38.01 
 
 
309 aa  178  7e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1607  chaperone protein DnaJ  34.84 
 
 
355 aa  178  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231275  normal  0.231372 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  33.8 
 
 
372 aa  176  4e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.71 
 
 
283 aa  176  4e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.48 
 
 
323 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  38.28 
 
 
297 aa  175  8e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  36.69 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1520  heat shock protein DnaJ-like  33.87 
 
 
327 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  39.66 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  39.86 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2130  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.59 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.192509  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  34.77 
 
 
385 aa  174  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  34.25 
 
 
380 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.33 
 
 
392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  39.52 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.18 
 
 
320 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  35.18 
 
 
378 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  35.05 
 
 
325 aa  172  5e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  34.81 
 
 
376 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4848  DnaJ family curved-DNA-binding protein  37.85 
 
 
319 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  34.63 
 
 
378 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  40.13 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1856  chaperone DnaJ domain protein  37.2 
 
 
328 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000127856  normal  0.0651455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4435  chaperone DnaJ domain protein  39 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360002  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4440  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  37.01 
 
 
314 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  34.81 
 
 
376 aa  172  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  40.94 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  34.81 
 
 
376 aa  172  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4726  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.85 
 
 
319 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  34.81 
 
 
376 aa  172  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  34.81 
 
 
376 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  34.81 
 
 
376 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  34.81 
 
 
376 aa  172  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  34.81 
 
 
376 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>