17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1403 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1403  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 		 85 aa  167  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1995  FmdB family regulatory protein  53.33 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.013154  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0583  regulatory protein, FmdB family  52.83 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0524  regulatory protein, FmdB family  37.18 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1459  hypothetical protein  50 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501931 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1274  FmdB family regulatory protein  44.74 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0746  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1286  regulatory protein, FmdB family  53.85 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3203  hypothetical protein  40.51 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0778  regulatory protein, FmdB family  42.37 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  42.11 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  47.73 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0644  hypothetical protein  38.16 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1512  hypothetical protein  53.49 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000051814  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  42.11 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0261  hypothetical protein  43.18 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7750  FmdB family regulatory protein  40.48 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.572116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>