47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2375 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2375  heavy metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 67 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00029773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1328  heavy metal-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 69 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0385321 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2002  heavy metal-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.288173  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3224  heavy metal transport/detoxification protein  35.94 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3169  Heavy metal transport/detoxification protein  38.46 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145614 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0460  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 748 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.792118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  38.71 
 
 		 976 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0995  Heavy metal transport/detoxification protein  29.23 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.330421  hitchhiker  0.00334247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  34.38 
 
 		 871 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0968  Heavy metal transport/detoxification protein  25.76 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  38.1 
 
 		 833 aa  44.7  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0933  heavy metal transport/detoxification protein  29.69 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.384582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  35.94 
 
 		 894 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2690  heavy metal translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 832 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 836 aa  44.7  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 887 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13340  Heavy metal transport/detoxification protein  35.48 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000868167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3243  heavy metal translocating P-type ATPase  34.33 
 
 		 841 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 832 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1572  heavy metal translocating P-type ATPase  38.6 
 
 		 856 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  39.34 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2657  copper ion binding protein  32.26 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.024328  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0982  copper-translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 861 aa  42  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.682171  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4090  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 813 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.670864 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0802  heavy metal translocating P-type ATPase  35.48 
 
 		 725 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0220  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 826 aa  41.6  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 802 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  35.82 
 
 		 838 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0490  heavy metal translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 744 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  35.48 
 
 		 817 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1786  copper-translocating P-type ATPase  30.16 
 
 		 789 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.143553  normal  0.0746934 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3603  Heavy metal transport/detoxification protein  36.51 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 757 aa  41.2  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 845 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 753 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0876  heavy metal translocating P-type ATPase  32.84 
 
 		 750 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20130  cation transport ATPase  31.67 
 
 		 76 aa  40.8  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00552668  normal  0.0128064 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10070  heavy metal transport/detoxification protein  32.84 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173108  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 734 aa  41.2  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0715  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 		 739 aa  40.8  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.073863  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9864  heavy-metal transporting P-type ATPase  31.75 
 
 		 826 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1232  Heavy metal transport/detoxification protein  26.87 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0066446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  33.87 
 
 		 804 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  30.16 
 
 		 844 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 868 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  35.29 
 
 		 799 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 926 aa  40  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>