38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2364 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2364  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 70 aa  141  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.754995  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0760  hypothetical protein  61.36 
 
 		 51 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0340  phage transcriptional regulator, AlpA  37.68 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  40.43 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  47.73 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1511  phage transcriptional regulator, AlpA  44.68 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2812  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.652167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1667  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.215931  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2857  phage transcriptional regulator, AlpA  41.38 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  42.55 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  39.29 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  42.22 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  43.48 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0653  phage transcriptional regulator, AlpA  40 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0437376  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0481  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.922024  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0567  phage transcriptional regulator, AlpA  46.88 
 
 		 75 aa  44.3  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  43.59 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2332  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0635  phage transcriptional regulator, AlpA  36.67 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.1566  normal  0.0401138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  44.19 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  34.78 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1000  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0048  phage transcriptional regulator, AlpA  41.86 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4006  AlpA family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1058  phage transcriptional regulator, AlpA  41.86 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1259  phage transcriptional regulator, AlpA  44.44 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.477494 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  40.68 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1231  Phage transcriptional regulator, AlpA  35.38 
 
 		 70 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1159  phage transcriptional regulator, AlpA  32.2 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0925485  normal  0.345427 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  41.86 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0716  phage transcriptional regulator, AlpA  33.96 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0683  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  34.15 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2960  phage DNA binding protein  35.56 
 
 		 88 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.630956  hitchhiker  0.00000157452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>