64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3936 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  100 
 
 		 318 aa  633  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  89.3 
 
 		 299 aa  528  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  77.59 
 
 		 299 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  77.59 
 
 		 299 aa  478  1e-134  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  71.38 
 
 		 299 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  71.38 
 
 		 299 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  73.02 
 
 		 287 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  68.01 
 
 		 299 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  65.22 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  65.55 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  65.55 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  65.22 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  65.22 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  65.22 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  65.55 
 
 		 299 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  64.88 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.77 
 
 		 291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  54.68 
 
 		 292 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  54.32 
 
 		 292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  51.56 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  52.35 
 
 		 286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  50.55 
 
 		 284 aa  278  9e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  49.47 
 
 		 287 aa  277  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  47.45 
 
 		 292 aa  268  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  51.25 
 
 		 292 aa  267  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.9 
 
 		 289 aa  266  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  48.07 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  50.87 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  51.26 
 
 		 290 aa  257  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  47.65 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  50.36 
 
 		 286 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  46.95 
 
 		 265 aa  247  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.04 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  50.36 
 
 		 286 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  49.47 
 
 		 292 aa  235  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  44.14 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.37 
 
 		 290 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.46 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.46 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.46 
 
 		 291 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  44.14 
 
 		 292 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.46 
 
 		 291 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  36.73 
 
 		 292 aa  192  9e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  38.03 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  25.62 
 
 		 282 aa  50.8  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 302 aa  49.7  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  25.1 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.91 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.5 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1902  hypothetical protein  25.88 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  21.31 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.87 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  27.89 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4998  hypothetical protein  27.04 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390809  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3580  hypothetical protein  25.99 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.122357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  24.9 
 
 		 327 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.12 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.63 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.33 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  24.22 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  27.21 
 
 		 331 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>