50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2439 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  100 
 
 		 295 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  83.22 
 
 		 292 aa  498  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  82.53 
 
 		 292 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  63.38 
 
 		 284 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  59.44 
 
 		 292 aa  367  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  61.27 
 
 		 291 aa  364  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  58.13 
 
 		 291 aa  338  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.14 
 
 		 289 aa  322  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  57.55 
 
 		 286 aa  322  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  58.87 
 
 		 265 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  55.94 
 
 		 287 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.59 
 
 		 287 aa  315  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.67 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.67 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  54.51 
 
 		 299 aa  311  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  56.88 
 
 		 287 aa  308  8e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  57.88 
 
 		 290 aa  305  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  54.24 
 
 		 299 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  55.07 
 
 		 288 aa  301  7.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.82 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.56 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.51 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.51 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.3 
 
 		 293 aa  289  4e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.51 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.51 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  50.51 
 
 		 299 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  50.51 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  50.51 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  53.19 
 
 		 292 aa  288  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  50.51 
 
 		 299 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.54 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  55.9 
 
 		 290 aa  285  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  52.65 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  53.9 
 
 		 292 aa  276  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.19 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  52.8 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  54.36 
 
 		 286 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  54.7 
 
 		 286 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.16 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.52 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  52.52 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  44.06 
 
 		 292 aa  216  2e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  38.46 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.46 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  23.89 
 
 		 282 aa  47.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  24.19 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4849  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  24.58 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.551565  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  23.74 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>