50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3822 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  96.92 
 
 		 292 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  83.62 
 
 		 293 aa  485  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  84.75 
 
 		 291 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  84.75 
 
 		 291 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  83.69 
 
 		 291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  83.69 
 
 		 291 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  71.83 
 
 		 286 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  71.13 
 
 		 286 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  71.28 
 
 		 290 aa  364  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  61.37 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  64.66 
 
 		 290 aa  322  5e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  52.8 
 
 		 295 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  52.1 
 
 		 292 aa  295  9e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  63.54 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  51.62 
 
 		 291 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  51.05 
 
 		 292 aa  288  6e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  50.72 
 
 		 286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  47.55 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  50.52 
 
 		 291 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  49.47 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.23 
 
 		 289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.76 
 
 		 299 aa  258  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  48.08 
 
 		 287 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.24 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  47.24 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  46.08 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.21 
 
 		 318 aa  252  5.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  45.65 
 
 		 292 aa  252  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  45.73 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  45.73 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  45.73 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  45.73 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  45.73 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  45.73 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  45.73 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  46.74 
 
 		 287 aa  249  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  45.64 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  46.53 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  45.58 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  49.04 
 
 		 265 aa  242  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  46.08 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  37.77 
 
 		 292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  37.41 
 
 		 286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.92 
 
 		 302 aa  116  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  23.29 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.25 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.29 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>