71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1652 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1652  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19150  hypothetical protein  96.5 
 
 		 286 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.475633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1433  carboxylate/amino acid/amine transporter  71.73 
 
 		 293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.720857  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4083  hypothetical protein  70.98 
 
 		 292 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114876  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4043  carboxylate/amino acid/amine transporter  71.99 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3830  carboxylate/amino acid/amine transporter  70.67 
 
 		 291 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4537  carboxylate/amino acid/amine transporter  72.7 
 
 		 291 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1354  carboxylate/amino acid/amine transporter  72.7 
 
 		 291 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.117278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3822  hypothetical protein  71.13 
 
 		 292 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1301  carboxylate/amino acid/amine transporter  70.73 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1597  hypothetical protein  64.26 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.483215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0261  hypothetical protein  63.41 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0339  hypothetical protein  65.61 
 
 		 292 aa  321  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.252118  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2439  MadN protein  54.7 
 
 		 295 aa  301  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0240  carboxylate/amino acid/amine transporter  56.27 
 
 		 287 aa  298  6e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.214328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001947  putative acetate efflux pump MadN  55.04 
 
 		 292 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1302  MadN protein  55.12 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00531  permease  54.32 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3954  carboxylate/amino acid/amine transporter  56.27 
 
 		 299 aa  292  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0263  carboxylate/amino acid/amine transporter  56.27 
 
 		 299 aa  292  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4358  carboxylate/amino acid/amine transporter  54.84 
 
 		 299 aa  292  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3969  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.76 
 
 		 299 aa  291  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2175  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.42 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000121987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4294  10 TMS Drug/Metabolite Exporter (DME) family  53.76 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4152  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.41 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4349  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  53.41 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4051  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  53.41 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4181  carboxylate/amino acid/amine transporter  53.41 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0864049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4194  10 TMS drug/metabolite exporter (DME) family protein  53.41 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209407 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1235  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.87 
 
 		 291 aa  287  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03655  hypothetical protein  53.41 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03706  predicted inner membrane protein  53.41 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1920  inner membrane protein  53.5 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0119644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4075  carboxylate/amino acid/amine transporter  54.12 
 
 		 299 aa  285  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  50.35 
 
 		 286 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01531  putative MadN protein  49.12 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.997992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3936  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.72 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3134  hypothetical protein  45.96 
 
 		 292 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0684  hypothetical protein  48.58 
 
 		 287 aa  265  1e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0183  carboxylate/amino acid/amine transporter  50.54 
 
 		 299 aa  259  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1276  hypothetical protein  49.64 
 
 		 288 aa  258  5.0000000000000005e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00521241  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1236  hypothetical protein  51.53 
 
 		 265 aa  254  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294327  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0974  conserved hypothetical protein, MadN family (DUF6 domain protein)  38.85 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.634271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2636  hypothetical protein  37.76 
 
 		 286 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 		 302 aa  132  7.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  30.22 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.91 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  29.38 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3468  hypothetical protein  23.97 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2607  hypothetical protein  28.77 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  26.51 
 
 		 319 aa  45.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2202  membrane protein  24.62 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00337301  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.55 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.11 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.21 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  23.18 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.21 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  23.66 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.66 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  24 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.13 
 
 		 321 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1144  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.82 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.953682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  22.47 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.21 
 
 		 294 aa  43.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.13 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  25.91 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  27.66 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.66 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2213  hypothetical protein  33.82 
 
 		 308 aa  42.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139395  normal  0.292035 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  26.05 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>