More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3368 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  100 
 
 
297 aa  605  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  87.84 
 
 
295 aa  524  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  87.5 
 
 
295 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  73.99 
 
 
287 aa  431  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  72.89 
 
 
279 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  73.99 
 
 
295 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  69.23 
 
 
279 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  62.95 
 
 
285 aa  361  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  63.67 
 
 
285 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  62.13 
 
 
276 aa  358  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  62.64 
 
 
277 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  61.68 
 
 
276 aa  355  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  61.17 
 
 
277 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  61.9 
 
 
277 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  62.45 
 
 
287 aa  351  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  60.66 
 
 
277 aa  344  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  61.03 
 
 
277 aa  342  4e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  60.44 
 
 
285 aa  340  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  60.73 
 
 
291 aa  339  4e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  61.17 
 
 
274 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  60.81 
 
 
274 aa  335  5e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  61.17 
 
 
274 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  61.4 
 
 
284 aa  333  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  61.03 
 
 
276 aa  330  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  57.66 
 
 
276 aa  329  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  60.29 
 
 
279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  59.85 
 
 
280 aa  324  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  54.83 
 
 
297 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  55.67 
 
 
301 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  58.39 
 
 
276 aa  298  6e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  55.32 
 
 
304 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  56.12 
 
 
304 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  53.71 
 
 
291 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  55.36 
 
 
292 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  55.6 
 
 
304 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  54.39 
 
 
304 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  54.39 
 
 
304 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  54.39 
 
 
304 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  53.79 
 
 
296 aa  289  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  56.34 
 
 
281 aa  278  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
293 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
293 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
293 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  55.16 
 
 
293 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
293 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  54.8 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  53.38 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  54.45 
 
 
293 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  55.6 
 
 
286 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  48.75 
 
 
291 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  45.35 
 
 
283 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  51.7 
 
 
276 aa  250  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  48.85 
 
 
543 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  47.62 
 
 
274 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  44.98 
 
 
278 aa  237  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  47.31 
 
 
543 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5509  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.33 
 
 
347 aa  236  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
333 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  49.42 
 
 
539 aa  236  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
325 aa  236  4e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  47.01 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  48.15 
 
 
537 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2439  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1778  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 
320 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000196447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  45.49 
 
 
333 aa  231  9e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.42 
 
 
342 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  47.14 
 
 
343 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.06 
 
 
336 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636824  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.89 
 
 
342 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 
329 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.32 
 
 
332 aa  229  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
359 aa  229  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
332 aa  228  6e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
609 aa  229  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2787  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
327 aa  228  8e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3308  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.77 
 
 
346 aa  228  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4246  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  46.1 
 
 
338 aa  228  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0259  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.99 
 
 
325 aa  227  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4393  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.72 
 
 
338 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4234  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 
338 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.93 
 
 
392 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4733  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  45.72 
 
 
338 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4611  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.72 
 
 
338 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.01 
 
 
351 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2856  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.79 
 
 
338 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal  0.843723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3504  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
339 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.307632  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2723  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 
324 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  0.451475 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
353 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.39 
 
 
333 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.991753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1848  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.79 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.980992  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.42 
 
 
353 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0999  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.29 
 
 
330 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1268  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 
540 aa  224  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0948  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 
330 aa  224  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  47.1 
 
 
539 aa  225  9e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4502  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.43 
 
 
329 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.301743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2451  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
326 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.281657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1146  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  46.04 
 
 
342 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2116  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  46.33 
 
 
553 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498075  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  49.42 
 
 
531 aa  224  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>