More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0711 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3634  cytochrome P450  77.73 
 
 
462 aa  761    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0711  cytochrome P450  100 
 
 
459 aa  943    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  37.45 
 
 
599 aa  320  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  39.09 
 
 
487 aa  319  7.999999999999999e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6014  cytochrome P450  37.47 
 
 
476 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5060  cytochrome P450  27.94 
 
 
455 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  24.31 
 
 
1053 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  26.14 
 
 
466 aa  133  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1542  cytochrome P450  25.4 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  24.77 
 
 
448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1110  cytochrome P450  26.22 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  23.77 
 
 
1055 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1139  cytochrome P450  26.22 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  24.26 
 
 
470 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  27.67 
 
 
437 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3921  cytochrome P450  25.06 
 
 
459 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.986656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  25.12 
 
 
466 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0827  cytochrome P450  22.93 
 
 
453 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00913269 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3729  cytochrome P450  24.73 
 
 
446 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  25.26 
 
 
1065 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  26.97 
 
 
462 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  26.7 
 
 
468 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  29.1 
 
 
464 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.05 
 
 
1065 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  25.96 
 
 
458 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  25.62 
 
 
1096 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  25.06 
 
 
441 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  26.24 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  25.8 
 
 
463 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.27 
 
 
1065 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  25.32 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.63 
 
 
1065 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  24.69 
 
 
1065 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.63 
 
 
1065 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  25.72 
 
 
429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  26.1 
 
 
469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0434  cytochrome P450-related protein  24.54 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  26.02 
 
 
461 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30690  predicted protein  21.58 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  26.28 
 
 
470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  24.06 
 
 
446 aa  117  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.21 
 
 
1065 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.21 
 
 
1065 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  24.43 
 
 
1065 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0813  cytochrome P450  23.82 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  23.88 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  24.31 
 
 
1063 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  25.45 
 
 
463 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  21.66 
 
 
560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06835  cytochrome P450, putative (Eurofung)  22.99 
 
 
1083 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  22.75 
 
 
1075 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1543  cytochrome P450  25.96 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.257407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3693  cytochrome P450  23.73 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.429017  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  27.65 
 
 
466 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4063  cytochrome P450  24.5 
 
 
517 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.457655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2143  cytochrome P450  24.39 
 
 
454 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  21.51 
 
 
1075 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0286  cytochrome P450  25.89 
 
 
452 aa  113  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  26.03 
 
 
445 aa  113  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2191  cytochrome P450  24.39 
 
 
454 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  25 
 
 
473 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  23.83 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0401  cytochrome P450  28.54 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0394038 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  25.12 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1386  cytochrome P450  24.37 
 
 
457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  25.19 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3645  FAD-binding oxidoreductase  22.25 
 
 
1072 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.368759  normal  0.294023 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07522  cytochrome P450, putative (Eurofung)  25.56 
 
 
501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.334119  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1356  cytochrome P450  24.54 
 
 
457 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4258  cytochrome P450  25.38 
 
 
1079 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192468  normal  0.353505 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01310  Cytochrome P450, putative  23.26 
 
 
582 aa  110  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4368  cytochrome P450  25.38 
 
 
1079 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0838268  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3045  cytochrome P450  25.25 
 
 
460 aa  110  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.192678  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01884  cytochrome P450, putative (Eurofung)  22.8 
 
 
544 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.602174  normal  0.575691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  25.94 
 
 
455 aa  107  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  28.33 
 
 
460 aa  107  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  24.2 
 
 
484 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  25.85 
 
 
459 aa  106  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  24.94 
 
 
466 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  24.12 
 
 
454 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  26.6 
 
 
470 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  26.81 
 
 
433 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  24.68 
 
 
467 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1643  cytochrome P450  22.15 
 
 
448 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0465138  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1920  cytochrome P450  24.46 
 
 
492 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.276792  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2103  cytochrome P450  26.04 
 
 
455 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.869814  hitchhiker  0.00839009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  23.89 
 
 
452 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1972  cytochrome P450  24.68 
 
 
525 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3752  cytochrome P450  25.72 
 
 
481 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  24.94 
 
 
466 aa  104  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1413  cytochrome P450  25.63 
 
 
490 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1896  cytochrome P450  24.21 
 
 
492 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  24.94 
 
 
447 aa  103  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3371  cytochrome P450  25.81 
 
 
478 aa  103  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  25.18 
 
 
471 aa  103  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  25.42 
 
 
464 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  22.25 
 
 
1373 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  23.37 
 
 
549 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  24.52 
 
 
471 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  22.25 
 
 
1373 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>