29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0477 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0477  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1663  hypothetical protein  91.4 
 
 
187 aa  351  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00975358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1228  hypothetical protein  67.39 
 
 
186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.229124 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2816  hypothetical protein  68.48 
 
 
186 aa  270  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.748611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0996  hypothetical protein  67.93 
 
 
186 aa  270  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2335  hypothetical protein  67.39 
 
 
186 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.33118  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3380  hypothetical protein  66.85 
 
 
186 aa  267  5e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.108778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4145  hypothetical protein  65.76 
 
 
186 aa  265  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.386904  hitchhiker  0.000515415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0639  hypothetical protein  65.22 
 
 
186 aa  263  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  normal  0.0260715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1450  hypothetical protein  64.67 
 
 
186 aa  262  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2293  hypothetical protein  64.67 
 
 
186 aa  261  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00172333  hitchhiker  0.000104376 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1316  hypothetical protein  63.59 
 
 
186 aa  259  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.321266  normal  0.18558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0564  hypothetical protein  62.5 
 
 
186 aa  248  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1526  hypothetical protein  37.89 
 
 
245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.788345  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59090  hypothetical protein  37.23 
 
 
255 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106639  normal  0.0122718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4455  hypothetical protein  36.7 
 
 
251 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2996  hypothetical protein  35.26 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3288  hypothetical protein  35.26 
 
 
183 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2916  hypothetical protein  35.26 
 
 
183 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1686  hypothetical protein  29.71 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3745  hypothetical protein  27.68 
 
 
193 aa  84.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1722  hypothetical protein  26.7 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2091  hypothetical protein  27.17 
 
 
193 aa  82.8  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0834916 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0612  hypothetical protein  26.09 
 
 
193 aa  82  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4112  hypothetical protein  27.66 
 
 
209 aa  82  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0305  hypothetical protein  28.04 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000258182 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1495  hypothetical protein  32.84 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3945  hypothetical protein  26.14 
 
 
201 aa  62.8  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00032062  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0620  hypothetical protein  28.42 
 
 
200 aa  61.2  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>