43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3149 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3149  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
391 aa  811    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0567281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3609  metallo-beta-lactamase family protein  76.73 
 
 
391 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0862663 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0918  metallo-beta-lactamase family protein  75.33 
 
 
384 aa  615  1e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2136  metallo-beta-lactamase family protein  67.27 
 
 
386 aa  566  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1722  metallo-beta-lactamase family protein  64.21 
 
 
382 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1616  metallo-beta-lactamase family protein  63.71 
 
 
385 aa  525  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00374588  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0509  metallo-beta-lactamase family protein  63.28 
 
 
385 aa  527  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.16796 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2374  beta-lactamase-like  33.52 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.26413  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1437  beta-lactamase domain protein  26.77 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.256229  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2076  beta-lactamase-like protein  26.72 
 
 
218 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1529  beta-lactamase domain protein  25 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1890  beta-lactamase domain-containing protein  28.44 
 
 
218 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1569  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0135813  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1077  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.32 
 
 
220 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0880  beta-lactamase domain-containing protein  24.49 
 
 
322 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0924  beta-lactamase-like protein  26.14 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.425794  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1774  beta-lactamase domain-containing protein  26.6 
 
 
221 aa  53.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1271  beta-lactamase domain-containing protein  26.2 
 
 
272 aa  53.1  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0068  beta-lactamase superfamily hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  53.1  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1960  beta-lactamase-like  26 
 
 
312 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1391  beta-lactamase domain-containing protein  20.95 
 
 
295 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00324967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0249  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 
280 aa  50.8  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000647283  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0446  beta-lactamase domain-containing protein  25.63 
 
 
267 aa  50.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.986653  hitchhiker  0.00213721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18400  beta-lactamase domain protein  25.22 
 
 
278 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.03744e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0561  beta-lactamase domain-containing protein  22.54 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1937  beta-lactamase domain-containing protein  28.21 
 
 
212 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2897  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 
327 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3463  beta-lactamase domain protein  31.13 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00409832  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1793  beta-lactamase domain protein  28.41 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000988324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1455  hypothetical protein  23.87 
 
 
260 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0495131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3123  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
276 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3847  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.47 
 
 
806 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1155  beta-lactamase domain-containing protein  30.68 
 
 
282 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0141595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0791  beta-lactamase domain-containing protein  27.53 
 
 
330 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00778966  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1747  beta-lactamase domain protein  20.78 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1863  hypothetical protein  41.79 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.992798  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  25.74 
 
 
781 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7304  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1140  beta-lactamase domain protein  23.98 
 
 
229 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0535  beta-lactamase domain protein  23.39 
 
 
262 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1945  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 
278 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1937  hypothetical protein  23.53 
 
 
280 aa  43.1  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.413348  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0308  beta-lactamase domain-containing protein  23.53 
 
 
284 aa  42.7  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000646424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>