More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3061 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3061  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  100 
 
 		 440 aa  896    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1253  malate dehydrogenase  67.89 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  67.2 
 
 		 439 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1539  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  68.81 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.664121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  64.13 
 
 		 757 aa  566  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0778  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  67.05 
 
 		 439 aa  566  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3637  malate dehydrogenase  68.18 
 
 		 439 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0625695  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0279  malic enzyme  64.99 
 
 		 759 aa  551  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3833  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  63.94 
 
 		 771 aa  553  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.701616  normal  0.763898 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2106  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  63.87 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2911  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  62 
 
 		 755 aa  543  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01220  NADP-dependent malate dehydrogenase  63.94 
 
 		 766 aa  537  1e-151  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189364  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  66.11 
 
 		 771 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  66.11 
 
 		 771 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  62.53 
 
 		 779 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  62.53 
 
 		 780 aa  535  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  63.57 
 
 		 749 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  63.32 
 
 		 773 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  63.57 
 
 		 749 aa  531  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  62.15 
 
 		 752 aa  530  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0027  malic enzyme  59.31 
 
 		 757 aa  528  1e-149  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376486  normal  0.721374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  62.02 
 
 		 761 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1262  malic enzyme  63.98 
 
 		 752 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00802649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  62.98 
 
 		 754 aa  523  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1651  malic enzyme  62.5 
 
 		 763 aa  518  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4071  malic enzyme  65.88 
 
 		 771 aa  518  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  59.86 
 
 		 752 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  60.66 
 
 		 751 aa  511  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  60.71 
 
 		 760 aa  511  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  60 
 
 		 751 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  60 
 
 		 759 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3484  malic enzyme  62.23 
 
 		 749 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  60 
 
 		 752 aa  503  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0298  malic enzyme  60.05 
 
 		 756 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000250182 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2664  malic enzyme  60.57 
 
 		 759 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2705  malic enzyme  60.57 
 
 		 759 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2731  malic enzyme  60.57 
 
 		 759 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2788  malic enzyme  60.05 
 
 		 756 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2838  malic enzyme  60.57 
 
 		 759 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2616  malic enzyme  60.57 
 
 		 759 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  60.05 
 
 		 756 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02354  malic enzyme  60.09 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1207  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  60.1 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.795246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1214  malic enzyme  60.1 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2592  malic enzyme  60.1 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  59.81 
 
 		 773 aa  497  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2609  malic enzyme  60.09 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3417  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.154841  normal  0.983896 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02316  hypothetical protein  60.09 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3352  malic enzyme  59.43 
 
 		 763 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.49326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3684  malic enzyme  60.09 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.392037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2073  malic enzyme  60.42 
 
 		 752 aa  496  1e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000040152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0754  malic enzyme  59.62 
 
 		 759 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0943824  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2829  malic enzyme  60.1 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.946085  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2877  malic enzyme  61.61 
 
 		 751 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.857329 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2741  malic enzyme  60.1 
 
 		 759 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3472  malic enzyme  59.38 
 
 		 759 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.382642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0990  malic enzyme  59.62 
 
 		 759 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3213  malic enzyme  59.38 
 
 		 759 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3292  malic enzyme  59.14 
 
 		 759 aa  491  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2328  malic enzyme  58.57 
 
 		 775 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283617  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3943  malic enzyme  59.52 
 
 		 758 aa  493  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00128716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  58.33 
 
 		 769 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  59.81 
 
 		 756 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  59.76 
 
 		 754 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  58.1 
 
 		 764 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7102  malic enzyme  58.31 
 
 		 763 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30073  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02395  malic enzyme  57.28 
 
 		 769 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.766678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  58.37 
 
 		 776 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4968  malic enzyme  59.05 
 
 		 762 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  59.32 
 
 		 761 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3674  malic enzyme  59.08 
 
 		 760 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0789225  hitchhiker  0.00000000707391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45330  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating) (NADP+)  61.15 
 
 		 422 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.696381  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  60.14 
 
 		 415 aa  488  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6546  malic enzyme  58.54 
 
 		 763 aa  491  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00415909  normal  0.365189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1582  malic enzyme  58.08 
 
 		 783 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4217  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  61.3 
 
 		 764 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.665335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2471  malic protein NAD-binding protein  59.72 
 
 		 751 aa  490  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2654  malic enzyme  60.48 
 
 		 751 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.820528 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0283  malic enzyme  58.84 
 
 		 760 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00767286 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  60.9 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2777  malic enzyme  61.76 
 
 		 757 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0405643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2958  malic enzyme  59.86 
 
 		 759 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.692294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  60.65 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  60.65 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2441  malic enzyme  59.12 
 
 		 777 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1324  malic enzyme  59.02 
 
 		 749 aa  486  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.591813  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  60.9 
 
 		 425 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  58.74 
 
 		 769 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0448  malic enzyme  58.16 
 
 		 758 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>