19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2198 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2198  EpsI family protein  100 
 
 
210 aa  435  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2442  hypothetical protein  48.33 
 
 
210 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.156071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1804  EpsI family protein  43.27 
 
 
208 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0848  hypothetical protein  40.58 
 
 
206 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.336203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2446  EpsI family protein  43.85 
 
 
208 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0671  EpsI family protein  39.15 
 
 
243 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3053  hypothetical protein  39.49 
 
 
206 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  30.54 
 
 
526 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  28.02 
 
 
533 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1978  hypothetical protein  29.88 
 
 
224 aa  79  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  27.32 
 
 
534 aa  74.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  29.53 
 
 
516 aa  72.8  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2341  hypothetical protein  26.99 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1791  hypothetical protein  24.06 
 
 
230 aa  58.5  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2351  EpsI family protein  23.84 
 
 
238 aa  53.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  22.64 
 
 
520 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  23.2 
 
 
550 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2002  hypothetical protein  24.19 
 
 
207 aa  43.9  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0247  hypothetical protein  22.28 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>