34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3699 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3699  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  903    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0055  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  53.83 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0350  putative GAF sensor protein  48.31 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0480  putative phytochrome sensor protein  50.79 
 
 		 448 aa  397  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3714  putative GAF sensor protein  50.56 
 
 		 448 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0630  putative GAF sensor protein  50.66 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3146  putative phytochrome sensor protein  41.37 
 
 		 466 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3048  putative GAF sensor protein  40.18 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3247  putative phytochrome sensor protein  40.49 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2916  putative GAF sensor protein  39.69 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.11422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1553  putative GAF sensor protein  35.11 
 
 		 448 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00827304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.38 
 
 		 1877 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1734  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  24.43 
 
 		 759 aa  53.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0439  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  24.43 
 
 		 766 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.293101  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3016  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  25.84 
 
 		 748 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0585389  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2784  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.5 
 
 		 764 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2930  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.5 
 
 		 764 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2576  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.73 
 
 		 755 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 755 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00423484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3197  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  24.16 
 
 		 749 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00965467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.04 
 
 		 995 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1939  GAF domain/His kinase A domain/HD domain-containing protein  27.75 
 
 		 787 aa  47.4  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.149852  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0508  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  24.73 
 
 		 495 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  22.1 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1045  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.04 
 
 		 134 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0950451  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.52 
 
 		 997 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0905  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  21.59 
 
 		 748 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3398  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  22.02 
 
 		 748 aa  44.7  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00100115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 464 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.24 
 
 		 1016 aa  44.3  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1133  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.2 
 
 		 744 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000186405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3823  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  22.91 
 
 		 748 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00003425  normal  0.576063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  21.43 
 
 		 499 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0864  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.84 
 
 		 744 aa  43.1  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00610428  normal  0.087178 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>