40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3413 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3413  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0084  methylation  38.58 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1351  hypothetical protein  36.05 
 
 		 213 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0542  hypothetical protein  37.6 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0882  hypothetical protein  32.39 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3596  hypothetical protein  37.82 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0469  hypothetical protein  36.22 
 
 		 458 aa  74.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000719923  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0257  general secretion pathway protein G  31.25 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2372  general secretion pathway protein G  29.31 
 
 		 144 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.411005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  32.35 
 
 		 162 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  32.2 
 
 		 145 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0468  methylation site  26.05 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000101161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29510  putative type II secretion system protein  25.69 
 
 		 144 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3595  hypothetical protein  33.94 
 
 		 266 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  34.85 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2923  general secretion pathway protein G  27.5 
 
 		 141 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.370501  normal  0.274003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4158  general secretion pathway protein G  32.48 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  27.12 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  28.45 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  28.45 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  28.46 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2706  ankyrin  34.43 
 
 		 262 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3221  general secretion pathway protein G  27.19 
 
 		 156 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24020  general secretion pathway protein G  27.97 
 
 		 148 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  28.07 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2032  general secretion pathway protein G  27.97 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1301  general secretion pathway protein G  32.17 
 
 		 146 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1480  protein of unknown function DUF1559  32.97 
 
 		 362 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0121  hypothetical protein  26.75 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418469  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1343  general secretion pathway protein G  27.35 
 
 		 160 aa  43.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.657967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1413  general secretion pathway protein G  26.61 
 
 		 144 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0288958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3525  hypothetical protein  32.23 
 
 		 212 aa  42.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.634437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  28.23 
 
 		 156 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1432  type II secretion systen protein G  27.19 
 
 		 209 aa  42  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.412586  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  28.07 
 
 		 146 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18680  type II secretion system protein G  27.87 
 
 		 143 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  27.73 
 
 		 158 aa  42  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  27.12 
 
 		 163 aa  42  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  26.72 
 
 		 159 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>