17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3596 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3596  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  550  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0469  hypothetical protein  39.39 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000719923  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0542  hypothetical protein  38.21 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3413  general secretion pathway protein H  37.82 
 
 
244 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0440547  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0468  methylation site  29.45 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000101161  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0084  methylation  24.62 
 
 
247 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1351  hypothetical protein  42.71 
 
 
213 aa  62.4  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0882  hypothetical protein  37.96 
 
 
236 aa  58.9  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1350  hypothetical protein  35.14 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2706  ankyrin  28.68 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3525  hypothetical protein  34.43 
 
 
212 aa  47.4  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.634437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1722  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  32.86 
 
 
143 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2471  protein of unknown function DUF1559  31.68 
 
 
338 aa  46.2  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0121  hypothetical protein  28.45 
 
 
240 aa  45.4  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0883  hypothetical protein  36.36 
 
 
440 aa  45.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.132646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3595  hypothetical protein  25.98 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3197  protein of unknown function DUF1559  33.87 
 
 
326 aa  42  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>