More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2583 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2583  respiratory nitrate reductase beta subunit  100 
 
 		 333 aa  695    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.68171  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1176  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  53.25 
 
 		 382 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129403  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2469  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  48.51 
 
 		 358 aa  352  4e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00523376  normal  0.704715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0025  DMSO reductase family type II enzyme, iron- sulfur subunit  48.5 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.380385  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1336  DMSO reductase family type II enzyme, iron-sulfur subunit  47.55 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0196  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.95 
 
 		 389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1902  4Fe-4S ferredoxin  43.08 
 
 		 317 aa  271  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0337  Selenate reductase  38.18 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.963468  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3400  nitrate reductase, beta subunit  31.96 
 
 		 491 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2705  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.93 
 
 		 508 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.59941  normal  0.077732 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1906  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.13 
 
 		 473 aa  217  2e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2171  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.62 
 
 		 489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1778  nitrate reductase, beta subunit  34.62 
 
 		 489 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.738392  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1707  nitrate reductase, beta subunit  34.62 
 
 		 489 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0965  nitrate reductase, beta subunit  33.02 
 
 		 513 aa  216  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3289  nitrate reductase, beta subunit  32.32 
 
 		 513 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0366444  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0498  nitrate reductase, beta subunit  33.89 
 
 		 473 aa  216  5e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.329648 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1933  respiratory nitrate reductase, beta subunit  34.69 
 
 		 491 aa  215  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.287323  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1972  nitrate reductase, beta subunit  34.69 
 
 		 491 aa  215  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.991087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2314  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.93 
 
 		 511 aa  215  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1955  respiratory nitrate reductase, beta subunit  34.69 
 
 		 491 aa  215  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.303944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0330  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.01 
 
 		 484 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000947818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3447  nitrate reductase, beta subunit  33.02 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.338628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1347  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.41 
 
 		 584 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1235  nitrate reductase subunit beta  34.13 
 
 		 513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2793  nitrate reductase, beta subunit  32.7 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.016415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13800  respiratory nitrate reductase beta subuni  34.13 
 
 		 513 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.104283 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0428  nitrate reductase, beta subunit  35.7 
 
 		 507 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.090133  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2892  nitrate reductase, beta subunit  32.18 
 
 		 512 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.161802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0437  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.7 
 
 		 507 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0538175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0776  nitrate reductase, beta subunit  34.52 
 
 		 513 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0121  nitrate reductase, beta subunit  33.95 
 
 		 509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1650  Selenate reductase  34.42 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1629  nitrate reductase, beta subunit  33.95 
 
 		 509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1544  nitrate reductase, beta subunit  33.95 
 
 		 509 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1978  respiratory nitrate reductase subunit beta  34.42 
 
 		 491 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2519  nitrate reductase, beta subunit  33.33 
 
 		 508 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176137  normal  0.84462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0298  respiratory nitrate reductase, beta subunit  31.95 
 
 		 512 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.609381  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1250  nitrate reductase, beta subunit  34.4 
 
 		 509 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3760  nitrate reductase, beta subunit  34.64 
 
 		 510 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.281422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1490  nitrate reductase, beta subunit  31.96 
 
 		 519 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.931673  normal  0.0718409 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0274  nitrate reductase, beta subunit  31.95 
 
 		 512 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542879  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1707  respiratory nitrate reductase beta subunit  35.71 
 
 		 510 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.145723 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0667  nitrate reductase, beta subunit  33.6 
 
 		 512 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.812713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5710  nitrate reductase, beta subunit  34.26 
 
 		 511 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6463  nitrate reductase, beta subunit  34.13 
 
 		 511 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1393  nitrate reductase 1, beta subunit  34.4 
 
 		 512 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01203  nitrate reductase 1, beta (Fe-S) subunit  34.4 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.714292  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2420  nitrate reductase, beta subunit  34.4 
 
 		 512 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0556426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2398  nitrate reductase, beta subunit  34.4 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000272064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1709  nitrate reductase 1, beta subunit  34.4 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0253644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1335  nitrate reductase, beta subunit  34.4 
 
 		 512 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00571547  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1404  respiratory nitrate reductase beta subunit  32.28 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.314304  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1021  respiratory nitrate reductase beta subunit  31.26 
 
 		 495 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0219724 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01213  hypothetical protein  34.4 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.552443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1110  nitrate reductase, beta subunit  34.75 
 
 		 513 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1376  nitrate reductase, beta subunit  34.4 
 
 		 512 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0922315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0249  nitrate reductase, beta subunit  31.24 
 
 		 502 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0794164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1914  nitrate reductase 1, beta subunit  34.4 
 
 		 512 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.288869  normal  0.118614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1377  nitrate reductase 1, beta subunit  34.4 
 
 		 511 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3085  nitrate reductase, beta subunit  34.13 
 
 		 525 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1854  nitrate reductase, beta subunit  33.87 
 
 		 520 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1894  nitrate reductase 1, beta subunit  34.4 
 
 		 511 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.256537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2636  nitrate reductase, beta subunit  33.97 
 
 		 489 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1899  nitrate reductase 1, beta subunit  34.4 
 
 		 511 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.404395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1560  nitrate reductase 1 subunit beta  34.13 
 
 		 512 aa  209  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.713297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1958  nitrate reductase 1 subunit beta  34.4 
 
 		 511 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0606  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.6 
 
 		 512 aa  209  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2235  nitrate reductase, beta subunit  31.84 
 
 		 514 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1002  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.42 
 
 		 527 aa  208  9e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1509  nitrate reductase, beta subunit  33.6 
 
 		 504 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0662  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.07 
 
 		 507 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.21299  normal  0.287133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3865  nitrate reductase, beta subunit  34.13 
 
 		 507 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0975  respiratory nitrate reductase oxidoreductase protein  34.04 
 
 		 515 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1582  nitrate reductase, beta subunit  31.82 
 
 		 508 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000310576  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2127  nitrate reductase, beta subunit  32.53 
 
 		 509 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.659753  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4670  nitrate reductase, beta subunit  33.6 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5683  nitrate reductase, beta subunit  30.3 
 
 		 509 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1695  nitrate reductase 2, beta subunit  35.11 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.890974  normal  0.401528 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2633  nitrate reductase, beta subunit  33.6 
 
 		 512 aa  207  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.56399  normal  0.025961 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1583  nitrate reductase 2, beta subunit  35.11 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4594  respiratory nitrate reductase beta subunit  34.11 
 
 		 510 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0204  nitrate reductase, beta subunit  34.22 
 
 		 483 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5384  nitrate reductase, beta subunit  33.07 
 
 		 511 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302612  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1693  nitrate reductase 2, beta subunit  35.11 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.595471 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3593  nitrate reductase, beta subunit  33.6 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.090244  normal  0.177223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1756  nitrate reductase 2 subunit beta  35.11 
 
 		 514 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2591  nitrate reductase, beta subunit  31.12 
 
 		 509 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3596  nitrate reductase, beta subunit  31.8 
 
 		 485 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.989414  hitchhiker  0.00578955 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1772  nitrate reductase, beta subunit  33.6 
 
 		 520 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4235  nitrate reductase, beta subunit  32.53 
 
 		 505 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.312126  normal  0.378344 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1764  nitrate reductase 2 subunit beta  35.11 
 
 		 514 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.939627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2634  nitrate reductase, beta subunit  33.96 
 
 		 523 aa  206  6e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.832447  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1331  respiratory nitrate reductase beta subunit  33.33 
 
 		 519 aa  206  7e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1923  nitrate reductase (beta subunit)  34.56 
 
 		 543 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1955  respiratory nitrate reductase beta subuni  33.33 
 
 		 512 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.089713 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01425  nitrate reductase 2 (NRZ), beta subunit  34.83 
 
 		 514 aa  204  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2758  nitrate reductase, beta subunit  33.07 
 
 		 517 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2189  nitrate reductase, beta subunit  34.83 
 
 		 514 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2626  nitrate reductase, beta subunit  33.07 
 
 		 517 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>