73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5329 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  66.67 
 
 
653 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  64.98 
 
 
652 aa  851    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  82.18 
 
 
651 aa  1092    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  64.29 
 
 
678 aa  841    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  61.89 
 
 
630 aa  777    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  65.38 
 
 
653 aa  827    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  66.67 
 
 
653 aa  845    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  66.82 
 
 
653 aa  845    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  66.97 
 
 
653 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  66.21 
 
 
678 aa  874    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  65.4 
 
 
650 aa  874    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  59.19 
 
 
688 aa  724    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  60.65 
 
 
631 aa  764    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  65.54 
 
 
651 aa  869    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  100 
 
 
650 aa  1341    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  66.56 
 
 
653 aa  865    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  66.97 
 
 
654 aa  881    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  64.95 
 
 
650 aa  870    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  68.39 
 
 
673 aa  897    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  66.97 
 
 
653 aa  846    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  66.06 
 
 
654 aa  873    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  68 
 
 
653 aa  856    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  57.83 
 
 
648 aa  697    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  61.5 
 
 
662 aa  810    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  66.67 
 
 
653 aa  845    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  66.21 
 
 
678 aa  874    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  42.69 
 
 
623 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  36.63 
 
 
583 aa  295  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  64.9 
 
 
253 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  33.33 
 
 
607 aa  242  2e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  37.76 
 
 
625 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  35.71 
 
 
630 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  28.51 
 
 
626 aa  145  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  29.05 
 
 
624 aa  127  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  29.19 
 
 
631 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  27.62 
 
 
612 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  28.63 
 
 
883 aa  74.7  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  29.52 
 
 
884 aa  69.3  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  25 
 
 
887 aa  67.8  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  21.38 
 
 
593 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0899  twin-arginine translocation pathway signal  26.2 
 
 
596 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0882402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  22.32 
 
 
672 aa  57.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  20.9 
 
 
593 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  25.55 
 
 
738 aa  55.5  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  23.08 
 
 
667 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  24.44 
 
 
715 aa  54.3  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  32.35 
 
 
587 aa  53.9  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.95 
 
 
593 aa  53.9  0.000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  20.25 
 
 
672 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  22.73 
 
 
662 aa  52  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  22.43 
 
 
699 aa  52  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2111  hypothetical protein  24.7 
 
 
638 aa  50.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3309  hypothetical protein  27.47 
 
 
632 aa  50.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  22.62 
 
 
699 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  25.85 
 
 
689 aa  50.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  22.62 
 
 
699 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  28.68 
 
 
476 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4690  twin-arginine translocation pathway signal  24.24 
 
 
639 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2540  protein of unknown function DUF839  23.28 
 
 
681 aa  48.9  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  29.91 
 
 
458 aa  48.9  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3845  hypothetical protein  27.81 
 
 
786 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0999872  normal  0.0977424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3152  hypothetical protein  22.98 
 
 
694 aa  47.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4261  protein of unknown function DUF839  30.88 
 
 
739 aa  47.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.813095 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3617  protein of unknown function DUF839  27.94 
 
 
669 aa  47.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.268423  normal  0.0412956 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2294  phosphatase  25.28 
 
 
689 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.090987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5179  twin-arginine translocation pathway signal  25.97 
 
 
633 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000297642  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0101  hypothetical protein  21.7 
 
 
624 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.517413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3891  hypothetical protein  24.63 
 
 
736 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.371803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  24.67 
 
 
638 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  25.74 
 
 
698 aa  45.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0300  phosphatase  22 
 
 
733 aa  45.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  25.86 
 
 
383 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5054  protein of unknown function DUF839  25.64 
 
 
444 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>