More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4555 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01253  aconitate hydratase  44.09 
 
 		 891 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0525201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2371  aconitate hydratase 1  44.09 
 
 		 891 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215516  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2068  aconitate hydratase 1  41.45 
 
 		 855 aa  694    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.461258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0846  aconitate hydratase  43.09 
 
 		 935 aa  653    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2112  aconitate hydratase  43.49 
 
 		 913 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0880837 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2340  aconitate hydratase  41.4 
 
 		 905 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0921  aconitate hydratase  40.95 
 
 		 901 aa  700    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.446396  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0105  aconitate hydratase  41.39 
 
 		 861 aa  682    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.227514  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2003  aconitate hydratase  41.03 
 
 		 901 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158915 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0091  aconitate hydratase  43.99 
 
 		 895 aa  691    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0330  aconitate hydratase  70.47 
 
 		 877 aa  1152    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00865335  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3635  aconitate hydratase  40.53 
 
 		 907 aa  697    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0235  aconitate hydratase  44.61 
 
 		 919 aa  685    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163774  normal  0.632766 
 
 
-
 
NC_004310  BR0093  aconitate hydratase  43.87 
 
 		 895 aa  689    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0064  aconitate hydratase  39.84 
 
 		 926 aa  637    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2016  aconitate hydratase 1  43.2 
 
 		 914 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1583  aconitate hydratase  43.92 
 
 		 873 aa  671    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3408  aconitate hydratase  40.53 
 
 		 907 aa  694    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3370  aconitate hydratase  40.53 
 
 		 907 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3320  aconitate hydratase  40.53 
 
 		 907 aa  694    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1755  aconitate hydratase  41.4 
 
 		 905 aa  650    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1406  aconitate hydratase 1  43.16 
 
 		 914 aa  695    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1659  aconitate hydratase  43.69 
 
 		 891 aa  708    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1653  aconitate hydratase  43.57 
 
 		 891 aa  706    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2731  aconitase  44.71 
 
 		 894 aa  724    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3404  aconitate hydratase  43.25 
 
 		 914 aa  692    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.342513  normal  0.354094 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1615  aconitate hydratase  41.4 
 
 		 905 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2061  aconitate hydratase  39.29 
 
 		 939 aa  653    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1925  aconitate hydratase  41.08 
 
 		 916 aa  677    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2478  aconitate hydratase  41.4 
 
 		 905 aa  649    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0931101  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2127  aconitate hydratase 1  43.57 
 
 		 903 aa  682    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0828  aconitate hydratase  42.35 
 
 		 883 aa  692    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00982227  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0714  aconitate hydratase  41.57 
 
 		 934 aa  678    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0323  aconitate hydratase  43.75 
 
 		 905 aa  684    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0800  aconitate hydratase  41.4 
 
 		 905 aa  649    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0493  aconitate hydratase  41.4 
 
 		 905 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1788  aconitate hydratase 1  43.46 
 
 		 907 aa  658    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.83905  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1823  aconitate hydratase  41.4 
 
 		 905 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3890  aconitate hydratase  42.51 
 
 		 913 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185515 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1806  aconitate hydratase  43.78 
 
 		 914 aa  712    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1903  aconitate hydratase  42.75 
 
 		 913 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0189889  normal  0.77377 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2158  aconitate hydratase  41.74 
 
 		 905 aa  652    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1016  aconitate hydratase  42.84 
 
 		 937 aa  642    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.827465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3677  aconitate hydratase  40.53 
 
 		 907 aa  694    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1881  aconitate hydratase 1  40.46 
 
 		 914 aa  668    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3511  aconitate hydratase  44.28 
 
 		 891 aa  682    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0654  aconitate hydratase  41.51 
 
 		 905 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0804  aconitate hydratase  45.33 
 
 		 873 aa  687    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1312  aconitase  42.19 
 
 		 927 aa  650    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0948394  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0291  aconitate hydratase  42.23 
 
 		 905 aa  694    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0448672 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0425  aconitase  44.39 
 
 		 890 aa  697    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.128588  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0600  aconitate hydratase 1  38.76 
 
 		 905 aa  652    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.778708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1031  aconitate hydratase  41.6 
 
 		 875 aa  690    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2646  aconitate hydratase  40.88 
 
 		 931 aa  679    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.581556  decreased coverage  0.00838168 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0620  aconitate hydratase  44.69 
 
 		 874 aa  681    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.343199  normal  0.507089 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1991  aconitase  41.88 
 
 		 937 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0204  aconitate hydratase  42.07 
 
 		 906 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0875867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3871  aconitate hydratase  76.53 
 
 		 888 aa  1276    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2192  aconitate hydratase  43.54 
 
 		 891 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000787755 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2903  aconitate hydratase  41.13 
 
 		 905 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.864497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0525  aconitate hydratase  42.69 
 
 		 905 aa  703    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4079  aconitate hydratase 1  44.37 
 
 		 984 aa  678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2962  aconitase  42.4 
 
 		 910 aa  685    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0408  aconitate hydratase  42.61 
 
 		 905 aa  689    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0914  aconitate hydratase 1  44.37 
 
 		 984 aa  678    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239942  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3627  aconitate hydratase  43.49 
 
 		 913 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.943938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2384  aconitate hydratase  39.67 
 
 		 935 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.780528 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1439  aconitate hydratase  40.56 
 
 		 901 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0727527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2492  aconitate hydratase  40.71 
 
 		 901 aa  644    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4240  aconitate hydratase 1  46.86 
 
 		 884 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0224  aconitase  43.22 
 
 		 907 aa  669    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1682  aconitate hydratase  43.06 
 
 		 906 aa  674    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00945136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1006  aconitate hydratase  40.39 
 
 		 915 aa  669    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2096  aconitate hydratase 1  45.16 
 
 		 891 aa  701    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.931453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4439  aconitate hydratase  41.51 
 
 		 905 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.604056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0365  aconitate hydratase  58.04 
 
 		 872 aa  988    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3768  aconitate hydratase  43.27 
 
 		 910 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1284  aconitate hydratase 1  41.71 
 
 		 907 aa  704    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1566  aconitate hydratase 1  41.53 
 
 		 949 aa  640    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.138862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3357  aconitate hydratase  44.43 
 
 		 896 aa  710    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0382  aconitate hydratase  42.89 
 
 		 905 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0212  aconitate hydratase  44.64 
 
 		 895 aa  695    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1454  aconitate hydratase 1  43.67 
 
 		 914 aa  691    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293979  normal  0.11612 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3083  aconitate hydratase  43.04 
 
 		 896 aa  692    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0230  aconitate hydratase 1  42.92 
 
 		 908 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3674  aconitate hydratase 1  42.38 
 
 		 920 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2861  aconitase  43.64 
 
 		 891 aa  701    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509308  normal  0.643421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3305  aconitate hydratase  41.63 
 
 		 905 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1282  aconitate hydratase  43.39 
 
 		 895 aa  692    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.14403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44290  aconitate hydratase  43.49 
 
 		 910 aa  695    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1467  aconitate hydratase  42.62 
 
 		 840 aa  674    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1246  aconitate hydratase  40.76 
 
 		 887 aa  666    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1644  aconitase  40.24 
 
 		 936 aa  643    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.417591  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3928  aconitate hydratase  41.51 
 
 		 905 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0464  aconitate hydratase  43.1 
 
 		 894 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.197482 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1412  aconitate hydratase  40.56 
 
 		 901 aa  684    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.881286  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1394  aconitase  42.79 
 
 		 926 aa  690    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.295353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0106  aconitase  43.15 
 
 		 922 aa  653    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3071  aconitate hydratase  59.48 
 
 		 854 aa  920    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4301  aconitate hydratase  42.24 
 
 		 919 aa  688    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>