21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3050 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3050  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter  100 
 
 		 196 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0820746  normal  0.460517 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5628  small permease component of tripartite tricarboxylate transporter (TctB)  48.39 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2228  hypothetical protein  46.01 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4225  hypothetical protein  41.72 
 
 		 166 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.360299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4492  hypothetical protein  41.96 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5725  hypothetical protein  42.44 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0156863  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0483  hypothetical protein  40.85 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2025  hypothetical protein  39.35 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0928756  normal  0.256497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1852  hypothetical protein  40.99 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.946732 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2796  hypothetical protein  36.88 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.825323  normal  0.0868424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3429  hypothetical protein  39.35 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0516258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3099  hypothetical protein  36.2 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36150  hypothetical protein  36.26 
 
 		 176 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000272635 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3082  hypothetical protein  35.67 
 
 		 176 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.583252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1219  hypothetical protein  29.45 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0261954  normal  0.740843 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  28.32 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  28.32 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  28.32 
 
 		 168 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0499  hypothetical protein  23.97 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0663  hypothetical protein  33.78 
 
 		 142 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.380884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2074  hypothetical protein  24.22 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>