26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0109 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0109  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 1225 aa  2402    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.85 
 
 		 2346 aa  295  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.31 
 
 		 3977 aa  192  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7459  hypothetical protein  35.37 
 
 		 826 aa  181  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240347  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  33.83 
 
 		 1231 aa  172  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  32.25 
 
 		 1089 aa  171  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33840  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1001 aa  120  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263623  normal  0.727273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4549  CHRD domain-containing protein  33.06 
 
 		 862 aa  110  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  37.58 
 
 		 1532 aa  95.9  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4263  hypothetical protein  30.52 
 
 		 343 aa  85.1  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.91 
 
 		 1284 aa  77  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.143266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3716  hypothetical protein  32.33 
 
 		 339 aa  71.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0772  fibronectin type III domain-containing protein  33.66 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2773  hypothetical protein  31.51 
 
 		 319 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3822  hypothetical protein  25.39 
 
 		 310 aa  64.3  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  34.51 
 
 		 746 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.51 
 
 		 1394 aa  62.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3349  hypothetical protein  30.09 
 
 		 328 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  40 
 
 		 1321 aa  58.9  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3220  hypothetical protein  30.81 
 
 		 307 aa  57.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1504 aa  55.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  30.81 
 
 		 9585 aa  50.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  31.06 
 
 		 1120 aa  47  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  31.68 
 
 		 1120 aa  47  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  30.19 
 
 		 1116 aa  45.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>