27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1091 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1091  virulence-related protein  100 
 
 
231 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0065  virulence-related protein  45.42 
 
 
286 aa  208  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1246  hypothetical protein  48.09 
 
 
229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2840  hypothetical protein  46.35 
 
 
230 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0394  hypothetical protein  46.81 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1481  hypothetical protein  39.09 
 
 
206 aa  155  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1637  virulence-related protein  36.41 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000825616  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1724  hypothetical protein  27.2 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.01564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0956  hypothetical protein  37.78 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.533596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3840  hypothetical protein  37.78 
 
 
320 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.332695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1866  hypothetical protein  36.67 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217313  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2817  hypothetical protein  29.24 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00958093  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2914  hypothetical protein  38.27 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.375403  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2890  hypothetical protein  38.27 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155885  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2849  hypothetical protein  23.36 
 
 
300 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0582  hypothetical protein  38.27 
 
 
307 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0674  hypothetical protein  40.24 
 
 
307 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0921  hypothetical protein  38.27 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1006  hypothetical protein  29.07 
 
 
307 aa  62.8  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2752  hypothetical protein  38.1 
 
 
342 aa  62.4  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0728  hypothetical protein  38.27 
 
 
307 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0791  hypothetical protein  38.27 
 
 
307 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0864  hypothetical protein  38.27 
 
 
307 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561346  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1504  hypothetical protein  35.71 
 
 
348 aa  58.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1635  hypothetical protein  35.82 
 
 
299 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000596322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1248  hypothetical protein  40.3 
 
 
299 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1727  hypothetical protein  36.92 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.719893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>