26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4601 on replicon NC_013163
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  100 
 
 
517 aa  1071    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  85.09 
 
 
918 aa  884    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  70.63 
 
 
517 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  40.13 
 
 
319 aa  248  1e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  40.19 
 
 
828 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  26.21 
 
 
632 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6695  hypothetical protein  25.34 
 
 
455 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.16594 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  24.23 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  24.35 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  22.08 
 
 
322 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  23.2 
 
 
325 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  23.64 
 
 
308 aa  64.7  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  28.5 
 
 
755 aa  63.9  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  24.52 
 
 
314 aa  62.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  22.89 
 
 
343 aa  60.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  24.11 
 
 
402 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  22.84 
 
 
320 aa  57  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0143  hypothetical protein  23.97 
 
 
608 aa  55.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192174  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  21.86 
 
 
311 aa  55.1  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  28.21 
 
 
319 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  28.57 
 
 
344 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0870  hypothetical protein  27.13 
 
 
311 aa  52  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  25 
 
 
297 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.2 
 
 
610 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0434  plasmid recombination protein  27.45 
 
 
631 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2740  hypothetical protein  28.16 
 
 
310 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>