56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3124 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3124  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.864245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1632  PilT protein domain protein  33.57 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1606  PilT protein domain protein  31.47 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4731  VagD  31.21 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.761951  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0602  PilT protein domain protein  34.72 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.191075  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4624  PilT domain-containing protein  29.66 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.723585  normal  0.112001 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3558  PilT domain-containing protein  27.34 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1623  virulence associated protein VagD, putative  30.5 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2129  virulence-associated protein, putative  28.37 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0156283  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1788  PilT protein domain protein  28.37 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.813085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3267  plasmid maintenance protein  29.05 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2951  PilT domain-containing protein  29.25 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1319  PilT protein domain protein  30.82 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3368  plasmid maintenance protein  29.05 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0138  PilT domain-containing protein  26.9 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36180  PilT domain-containing protein  28.17 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3729  PilT protein-like  31.76 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1868  PilT domain-containing protein  26.9 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000212984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1127  PilT domain-containing protein  29.14 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.539233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1566  PilT domain-containing protein  32.39 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123163  normal  0.225999 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1771  hypothetical protein  28.08 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1213  virulence associated protein C  28.08 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1545  PilT domain-containing protein  31.69 
 
 		 140 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.230093  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4794  PilT protein-like  27.97 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3320  PilT protein-like  26.9 
 
 		 133 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3732  nucleic acid-binding protein  29.17 
 
 		 132 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4147  PilT domain-containing protein  28.87 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.448502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2661  PilT domain-containing protein  27.97 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2719  PilT protein-like  27.89 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.116591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2669  PilT protein-like  25.52 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0691561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3680  PilT protein domain protein  24.82 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4574  PilT domain-containing protein  30.61 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0680986  normal  0.0209411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4124  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113441  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1681  PilT protein-like  27.66 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116331  normal  0.664267 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0442  nitrogen regulatory protein NtrR  30.14 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.315733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2777  PilT protein domain protein  29.25 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0894  PilT protein, N-terminal  25.52 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0440  PilT protein-like  26.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000179252  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1063  PilT protein domain protein  27.66 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.471234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0154  PilT domain-containing protein  25.52 
 
 		 133 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1484  hypothetical protein  28.28 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.174904  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0898  PilT protein domain protein  29.86 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.0272728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1823  PilT domain-containing protein  25.71 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.402154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1045  virulence-associated protein, putative  26.21 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.491192  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1777  PilT domain-containing protein  28.17 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.406004  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1045  putative nucleic acid-binding protein  34.33 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.883513  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6255  PilT domain-containing protein  28.08 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0358672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1461  PilT protein domain protein  24.11 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1325  nucleic acid binding protein  26.21 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000000354508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2472  virulence associated protein C  32.89 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00148493  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3269  PilT protein-like  30.5 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159462  hitchhiker  0.00995267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0688  PilT domain-containing protein  26.53 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.442109  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  30.07 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1048  PilT protein domain protein  35.38 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.71366  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6878  PilT domain-containing protein  28.28 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.425666  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2721  PilT protein-like protein  33.8 
 
 		 125 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>