40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0675 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  100 
 
 
413 aa  849    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  73.57 
 
 
416 aa  626  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  72.38 
 
 
416 aa  615  1e-175  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  70.45 
 
 
420 aa  608  1e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  63.02 
 
 
387 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  63.02 
 
 
387 aa  534  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  63.03 
 
 
452 aa  529  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  54.22 
 
 
731 aa  382  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  40.2 
 
 
365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  38.56 
 
 
363 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  38.11 
 
 
357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  36.07 
 
 
366 aa  229  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  36.71 
 
 
365 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  35.57 
 
 
361 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  35.56 
 
 
366 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  35.18 
 
 
360 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  35.18 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  35.44 
 
 
368 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  34.77 
 
 
1035 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  44.27 
 
 
903 aa  127  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1967  ABC-type phosphate transport system periplasmic component-like  38.89 
 
 
862 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.543569  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  28 
 
 
261 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  29.71 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  26.24 
 
 
251 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  27.04 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  31.62 
 
 
235 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  25.37 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  33.82 
 
 
244 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20131  hypothetical protein  34.04 
 
 
163 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  27.07 
 
 
251 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  27.41 
 
 
248 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1114  hypothetical protein  30.52 
 
 
413 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0990251  normal  0.0233772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  26.61 
 
 
273 aa  60.1  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  30.23 
 
 
221 aa  59.3  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1134  hypothetical protein  30.77 
 
 
466 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00871122  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1203  hypothetical protein  30.07 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502395  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1075  hypothetical protein  30.07 
 
 
447 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0167  hypothetical protein  32.91 
 
 
497 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  21.47 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  26.49 
 
 
236 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>