32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4076 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4076  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  100 
 
 
378 aa  760    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.268162 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4436  hypothetical protein  49.3 
 
 
357 aa  360  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5599  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  34.9 
 
 
335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3032  twin-arginine translocation pathway signal  27.13 
 
 
348 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000338526  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4881  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.77 
 
 
333 aa  53.1  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.730601  normal  0.999131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0402  NMT1/THI5 like domain protein  25.86 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1198  signal peptide protein  27.03 
 
 
349 aa  49.7  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2758  NMT1/THI5 like domain protein  26.17 
 
 
354 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512132  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1035  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  23.93 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1309  NMT1/THI5-ike domain protein  24.55 
 
 
375 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.135752  hitchhiker  0.0000217604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2431  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  23.29 
 
 
373 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946473  normal  0.133086 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2272  putative signal peptide protein  23.68 
 
 
349 aa  48.1  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.863816  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0248  histidine kinase  30.17 
 
 
1065 aa  47  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1042  NMT1/THI5 like domain protein  27.61 
 
 
349 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.778479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1820  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  25.82 
 
 
327 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.246405 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4555  NMT1/THI5 like domain protein  22.74 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2065  NMT1/THI5 like domain protein  27.64 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411496  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  24.55 
 
 
593 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1347  NMT1/THI5-like domain-containing protein  23.02 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1726  putative diguanylate cyclase  33.33 
 
 
778 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1134  NMT1/THI5 like domain protein  27.17 
 
 
349 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0977895  normal  0.576381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2628  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
1238 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.891716  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2122  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0485775  normal  0.0522703 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2868  NMT1/THI5 like domain protein  26.14 
 
 
364 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.51119  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1579  NMT1/THI5-like domain-containing protein  28.4 
 
 
342 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
915 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5419  NMT1/THI5 like domain protein  23.61 
 
 
345 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6358  putative sulfonate ABC transporter, substrate-binding protein  28.57 
 
 
324 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2748  extracellular solute-binding protein  30.93 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1136  NMT1/THI5-like domain-containing protein  22.84 
 
 
351 aa  42.7  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3906  WD-40 repeat-containing protein  24.03 
 
 
343 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3168  ABC transporter, periplasmic binding protein  24.03 
 
 
343 aa  42.7  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>