15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2957 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2957  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.501935  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7157  hypothetical protein  30.73 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.954255  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1243  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
379 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.447252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5615  hypothetical protein  28.19 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615672  normal  0.438645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4386  hypothetical protein  30.36 
 
 
243 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4168  hypothetical protein  32.77 
 
 
260 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.578911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1708  hypothetical protein  30.74 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5480  hypothetical protein  38.03 
 
 
264 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0124495  decreased coverage  0.00330894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1539  putative ABC transporter transmembrane protein  28.42 
 
 
280 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.124741 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2733  hypothetical protein  35.78 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.210858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0257  hypothetical protein  25.09 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7840  integral membrane protein  34.83 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.088066 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06370  hypothetical protein  25.9 
 
 
265 aa  42  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1241  hypothetical protein  32.03 
 
 
279 aa  42  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39140  hypothetical protein  28.35 
 
 
255 aa  42  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.405828 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>