270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2757 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  100 
 
 		 538 aa  1076    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  41.25 
 
 		 531 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0112  sodium/hydrogen exchanger  38.89 
 
 		 527 aa  356  5.999999999999999e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2920  potassium/proton antiporter  38.66 
 
 		 477 aa  322  8e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3454  potassium/proton antiporter  35.03 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00729546  normal  0.358 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0407  potassium/proton antiporter  33.48 
 
 		 486 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1203  potassium/proton antiporter  36.67 
 
 		 486 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.195277  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  35.21 
 
 		 478 aa  246  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0908  potassium/proton antiporter  35.65 
 
 		 497 aa  240  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.709599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1035  potassium/proton antiporter  33.48 
 
 		 483 aa  239  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  33.78 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  33.98 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  32.77 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0381  potassium/proton antiporter  33.54 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1841  Na(+)/H(+) exchanger  31.67 
 
 		 485 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  hitchhiker  0.00748386 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1689  hypothetical protein  33.57 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03170  cell volume regulation protein CvrA  32.97 
 
 		 485 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1466  sodium/hydrogen exchanger  31.6 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.576685  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0921  sodium/hydrogen exchanger  31.36 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0538395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3190  sodium/hydrogen exchanger  31.97 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2252  sodium/hydrogen exchanger  35.03 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.976938  normal  0.212899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  32.27 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.87 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  34.2 
 
 		 597 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45090  potassium/proton antiporter  30.96 
 
 		 582 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00181989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3191  potassium/proton antiporter  35.15 
 
 		 580 aa  195  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1867  potassium/proton antiporter  30.68 
 
 		 573 aa  195  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 		 406 aa  193  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0560  potassium/proton antiporter  31.41 
 
 		 581 aa  193  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.761529  hitchhiker  0.0000000416087 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  32.68 
 
 		 572 aa  192  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2361  potassium/proton antiporter  30.67 
 
 		 577 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.325914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  29.69 
 
 		 588 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1943  potassium/proton antiporter  31.7 
 
 		 577 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00285963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1939  potassium/proton antiporter  31.7 
 
 		 577 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.058645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1332  potassium/proton antiporter  31.7 
 
 		 577 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000612144  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1517  potassium/proton antiporter  31.7 
 
 		 577 aa  190  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.044428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1999  potassium/proton antiporter  31.47 
 
 		 577 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.861236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2255  sodium/hydrogen exchanger  31.99 
 
 		 573 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.272655  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0729  potassium/proton antiporter  31.47 
 
 		 572 aa  187  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3634  potassium/proton antiporter  33.42 
 
 		 626 aa  187  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2517  potassium/proton antiporter  31.82 
 
 		 590 aa  187  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0910  potassium/proton antiporter  31.56 
 
 		 576 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.490198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0935  potassium/proton antiporter  31.56 
 
 		 576 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.108607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3425  potassium/proton antiporter  31.56 
 
 		 576 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0240027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5116  potassium/proton antiporter  30.75 
 
 		 580 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  30.66 
 
 		 580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0944  potassium/proton antiporter  31.33 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.66 
 
 		 598 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  29.34 
 
 		 581 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0640  sodium/hydrogen exchanger  34.87 
 
 		 411 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0650  potassium/proton antiporter  30.68 
 
 		 590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5066  potassium/proton antiporter  30.53 
 
 		 580 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4939  potassium/proton antiporter  30.53 
 
 		 580 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 605 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3071  potassium/proton antiporter  29.91 
 
 		 574 aa  183  7e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.57549  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0966  potassium/proton antiporter  29.92 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.230877  unclonable  0.0000431742 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  34.49 
 
 		 598 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0400  potassium/proton antiporter  30.53 
 
 		 580 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.763312 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0446  potassium/proton antiporter  30.75 
 
 		 580 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0536009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1549  potassium/proton antiporter  29.94 
 
 		 575 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1658  potassium/proton antiporter  29.94 
 
 		 575 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3747  potassium/proton antiporter  31.06 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0847  potassium/proton antiporter  30.02 
 
 		 574 aa  179  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0572  sodium/hydrogen exchanger  30.5 
 
 		 575 aa  178  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3088  potassium/proton antiporter  29.8 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0092711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0884  potassium/proton antiporter  29.8 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00781318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1957  potassium/proton antiporter  30.56 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0260417  normal  0.308586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1349  potassium/proton antiporter  30.56 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.401684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  30 
 
 		 581 aa  176  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1678  potassium/proton antiporter  30.56 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000113521  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1336  potassium/proton antiporter  30.56 
 
 		 578 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000106159  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3583  sodium/hydrogen exchanger  34.56 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3438  potassium/proton antiporter  35.14 
 
 		 616 aa  176  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8651  potassium/proton antiporter  31.55 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3692  potassium/proton antiporter  31.47 
 
 		 500 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000164721  normal  0.675965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  31.25 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3821  potassium/proton antiporter  30.58 
 
 		 574 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000259426  hitchhiker  0.000169781 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01166  potassium/proton antiporter  29.89 
 
 		 578 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2457  sodium/hydrogen exchanger  29.89 
 
 		 578 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000399384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1294  potassium/proton antiporter  29.89 
 
 		 578 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000808232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01176  hypothetical protein  29.89 
 
 		 578 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0803034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2434  potassium/proton antiporter  29.89 
 
 		 578 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.010009  normal  0.436306 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1831  sodium/hydrogen exchanger  33.42 
 
 		 598 aa  173  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000205605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  32.64 
 
 		 597 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2947  sodium/hydrogen exchanger  29.19 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5758  potassium/proton antiporter  30.06 
 
 		 580 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3240  potassium/proton antiporter  30.48 
 
 		 624 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.526693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0500  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0245914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  35.2 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5829  sodium/hydrogen exchanger  30.51 
 
 		 593 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.626917  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  29.8 
 
 		 592 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  31.44 
 
 		 597 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5749  potassium/proton antiporter  27.44 
 
 		 492 aa  171  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0152205  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0298  potassium/proton antiporter  27.91 
 
 		 505 aa  169  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12158  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3537  potassium/proton antiporter  32.55 
 
 		 624 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3197  potassium/proton antiporter  27.72 
 
 		 497 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000394197  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2406  sodium/hydrogen exchanger  29.45 
 
 		 491 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.908088  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0650  sodium/hydrogen exchanger  30.08 
 
 		 492 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.939557  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0919  sodium/hydrogen exchanger  30.65 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0469679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3728  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 		 496 aa  163  7e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>