44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2226 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2226  FkbH like protein  100 
 
 
548 aa  1109    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2594  FkbH like protein  42.99 
 
 
549 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.101035  hitchhiker  0.00164087 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0884  FkbH like protein  32.05 
 
 
637 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.615612  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1535  hypothetical protein  32.19 
 
 
637 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0185  FkbH like protein  31.83 
 
 
637 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0758547  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6431  FkbH like protein  34.25 
 
 
721 aa  289  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0351897  normal  0.0864936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3944  FkbH domain-containing protein  32.75 
 
 
687 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.544993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1633  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  37.72 
 
 
897 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0549142  normal  0.0235477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0282  FkbH domain-containing protein  32.3 
 
 
592 aa  258  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  36.71 
 
 
2752 aa  257  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3738  FkbH like protein  32.94 
 
 
1231 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0423979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0150  FkbH like protein  33.51 
 
 
563 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3684  FkbH like protein  32.94 
 
 
1231 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1200  FkbH like protein  38.59 
 
 
535 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0415  HAD family phosphatase  31.62 
 
 
642 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.4216  normal  0.0403594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4651  FkbH like protein  35.56 
 
 
635 aa  246  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2153  FkbH like protein  33.59 
 
 
625 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  33.84 
 
 
7122 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2320  FkbH like protein  33.43 
 
 
582 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.892737  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  32.12 
 
 
3811 aa  193  6e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0172  enzyme involved in methoxymalonyl-ACP biosynthesis-like  35.63 
 
 
549 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2515  FkbH domain-containing protein  31.74 
 
 
613 aa  171  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.462669  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3196  FkbH like protein  26.98 
 
 
561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1491  HAD family phosphatase  29.75 
 
 
520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.825036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3866  HAD-superfamily phosphatase subfamily IIIC/FkbH domain-containing protein  28.06 
 
 
730 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.363659 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1304  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  29.53 
 
 
507 aa  140  7e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.244283  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0421  HAD family phosphatase  29.72 
 
 
520 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1318  HAD family phosphatase  29.48 
 
 
520 aa  139  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.427929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1174  FkbH like protein  31.31 
 
 
367 aa  136  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.359862  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0989  FkbH like protein  29.31 
 
 
350 aa  136  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7010  FkbH like protein  28.37 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1464  FkbH like protein  30.3 
 
 
340 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3971  FkbH like protein  29.03 
 
 
356 aa  133  6.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.692918  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3415  FkbH like protein  28.94 
 
 
347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2947  FkbH like protein  28.57 
 
 
393 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0774889  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3282  FkbH like protein  29.25 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.491106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3188  FkbH like protein  27.44 
 
 
430 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.585705  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1684  FkbH like protein  30.75 
 
 
623 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1195  FkbH domain-containing protein  27.76 
 
 
349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82412  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1089  FkbH like protein  29.31 
 
 
344 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1964  hypothetical protein  25.17 
 
 
572 aa  86.7  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.378575  normal  0.035089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0627  FkbH like protein  24.57 
 
 
631 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.248641  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2835  HAD family phosphatase  26.92 
 
 
590 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0212505  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3486  hypothetical protein  34.78 
 
 
142 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222229  normal  0.031709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>