16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1135 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  100 
 
 		 324 aa  663    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  38.75 
 
 		 549 aa  101  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  29.74 
 
 		 482 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  31.43 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  29.03 
 
 		 513 aa  89.4  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  33.33 
 
 		 489 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  29.56 
 
 		 775 aa  85.9  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  31.25 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  30.46 
 
 		 553 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  28.3 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  28.22 
 
 		 1149 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0751  hypothetical protein  32.14 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  29.46 
 
 		 527 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  28.66 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  29.81 
 
 		 439 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  24.71 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>