40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0315 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0315  putative RNA polymerase sigma factor SigI  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0403  putative RNA polymerase sigma factor SigI  49.17 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0521455  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1739  putative RNA polymerase sigma factor SigI  43.55 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0268  putative RNA polymerase sigma factor SigI  45.35 
 
 		 265 aa  191  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0058  putative RNA polymerase sigma factor SigI  42.98 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2120  putative RNA polymerase sigma factor SigI  43.75 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0832  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.76 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2975  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.24 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1272  putative RNA polymerase sigma factor SigI  38.52 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2038  putative RNA polymerase sigma factor SigI  36.44 
 
 		 236 aa  143  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2309  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.16 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0074  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.56 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3361  putative RNA polymerase sigma factor SigI  37.09 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0602386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2112  putative RNA polymerase sigma factor SigI  30.65 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1128  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.17 
 
 		 255 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.552744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3122  putative RNA polymerase sigma factor SigI  34.29 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0135176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3204  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.33 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0084081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3445  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.86 
 
 		 235 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3231  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.86 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.625131  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1698  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.19 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.734467 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3483  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.86 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3441  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.86 
 
 		 235 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.246792  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3137  putative RNA polymerase sigma factor SigI  32.86 
 
 		 240 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3433  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.81 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1813  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.81 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4761  putative RNA polymerase sigma factor SigI  30.49 
 
 		 237 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000200193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1048  putative RNA polymerase sigma factor SigI  30.62 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2521  putative RNA polymerase sigma factor SigI  35.41 
 
 		 235 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000234194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0661  putative RNA polymerase sigma factor SigI  33.79 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00767119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1584  putative RNA polymerase sigma factor SigI  31.22 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0944  putative RNA polymerase sigma factor SigI  30.43 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000529876  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1805  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  43.42 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2000  sporulation sigma factor SigG  27.05 
 
 		 256 aa  48.9  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000480045  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  32.18 
 
 		 257 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0863  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  27.47 
 
 		 245 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1901  sporulation sigma factor SigG  24.54 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  30 
 
 		 239 aa  45.4  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2014  sporulation sigma factor SigG  32.18 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1732  sporulation sigma factor SigG  32.18 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0249664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  29.9 
 
 		 245 aa  42  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>