21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1908 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  41.38 
 
 		 287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  34.47 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  32.26 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  28.94 
 
 		 274 aa  128  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  29.87 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  28.06 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  28.42 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3578  hypothetical protein  26.92 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  34.4 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0899  hypothetical protein  37.5 
 
 		 155 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  32.14 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  38.46 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1970  hypothetical protein  27.97 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0162497  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  22.94 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3520  hypothetical protein  25 
 
 		 172 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1574  putative transmembrane anti-sigma factor  23.08 
 
 		 253 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  32.35 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1665  hypothetical protein  25.76 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  31.65 
 
 		 242 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  26.21 
 
 		 206 aa  42.4  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.793553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>