24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0320 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1137  hypothetical protein  35.2 
 
 		 152 aa  60.1  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  33.94 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  29.13 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  29.2 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  32.43 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  32.43 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  23.73 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  29.27 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  31.53 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  24.79 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3092  hypothetical protein  27.74 
 
 		 147 aa  47  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  30.47 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3375  DoxX  28.47 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.239229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  26.72 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  32.11 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4788  DoxX  31.82 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  31.15 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2062  DoxX  31.19 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  30.51 
 
 		 153 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  26.05 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  27.2 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>