23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3264 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3264  Ig domain-containing protein  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  37.97 
 
 
526 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1975  Ig domain-containing protein  42.42 
 
 
730 aa  52.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000242777  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  40 
 
 
1937 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  40 
 
 
1467 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  45.1 
 
 
399 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 
1193 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  34.09 
 
 
600 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3510  Ig domain-containing protein  60 
 
 
811 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000494417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  32.14 
 
 
1300 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  33.01 
 
 
1821 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  50 
 
 
1048 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  34.52 
 
 
437 aa  46.2  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  55.26 
 
 
688 aa  45.8  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  26.67 
 
 
331 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  39.22 
 
 
466 aa  45.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  44.9 
 
 
4630 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.19 
 
 
752 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  40.79 
 
 
554 aa  42.7  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  39.34 
 
 
1418 aa  42.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  51.43 
 
 
1965 aa  42.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  32 
 
 
556 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  27.41 
 
 
1009 aa  42  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>