More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3025 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3025  major facilitator transporter  100 
 
 		 422 aa  842    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0628  glycerol-3-phosphate transporter  22.72 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000215527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0661  glycerol-3-phosphate transporter  22.72 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00772133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0729  glycerol-3-phosphate transporter  22.96 
 
 		 449 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.221122  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0572  glycerol-3-phosphate transporter  22.47 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00224555  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0571  glycerol-3-phosphate transporter  22.96 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00198632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0718  glycerol-3-phosphate transporter  22.47 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000170433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4646  glycerol-3-phosphate transporter  22.72 
 
 		 449 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000791973  unclonable  8.6547e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0790  glycerol-3-phosphate transporter  22.96 
 
 		 449 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000864698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0692  glycerol-3-phosphate transporter  22.72 
 
 		 449 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00296748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  22.25 
 
 		 449 aa  94  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  21.89 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  21.45 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  21.07 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  20.21 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4940  glycerol-3-phosphate transporter  22.55 
 
 		 444 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  21.9 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  21.88 
 
 		 446 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94723  MFS family transporter: glycerol-3-phosphate  22.41 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.000449836 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  20.36 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5381  phosphoglycerate transporter family protein  22.51 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5109  phosphoglycerate transporter family protein  22.25 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5500  phosphoglycerate transporter family protein  22.25 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.4 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5573  phosphoglycerate transporter family protein  22.55 
 
 		 444 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.4 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5375  phosphoglycerate transporter family protein  21.93 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4955  glycerol-3-phosphate transporter  22.22 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5429  phosphoglycerate transporter family protein  21.93 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  21.52 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5051  phosphoglycerate transporter  21.9 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5349  phosphoglycerate transporter family protein  21.69 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  21.52 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  23.3 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  21.52 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.67 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.77 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  20.73 
 
 		 441 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  22.77 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.36 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.47 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  20.66 
 
 		 436 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4014  regulatory protein UhpC  21.05 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.13 
 
 		 452 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4119  regulatory protein UhpC  21.05 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4069  regulatory protein UhpC  21.05 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4177  regulatory protein UhpC  21.05 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3998  regulatory protein UhpC  21.05 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  21 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2870  glycerol-3-phosphate transporter  22.44 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1562  major facilitator transporter  20.88 
 
 		 450 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4252  regulatory protein UhpC  21.25 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.36 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0225  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.23 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.95 
 
 		 448 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3790  phosphoglycerate transporter  21.47 
 
 		 446 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4175  regulatory protein UhpC  20.91 
 
 		 439 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03551  membrane protein regulates uhpT expression  20.91 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0036  phosphoglycerate transporter  20.91 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  24.07 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03493  hypothetical protein  20.91 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0032  regulatory protein UhpC  20.91 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.28 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0511  glycerol 3-phosphate transporter  21.09 
 
 		 481 aa  75.1  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000061877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3880  regulatory protein UhpC  20.91 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5097  regulatory protein UhpC  20.91 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.113676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0029  regulatory protein UhpC  20.1 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  23.7 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4032  regulatory protein UhpC  20.91 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47751 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000092  hexose phosphate transport protein  23.98 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.149187  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.47 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  21.25 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.34 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.140488  normal  0.0295712 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0212  sugar phosphate antiporter  23.87 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  19.13 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0206  sugar phosphate antiporter  23.87 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  19.39 
 
 		 483 aa  72  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2060  glycerol-3-phosphate transporter  22.86 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  20.65 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0646  putative regulatory protein UhpC  20.91 
 
 		 459 aa  72  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  19.42 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4149  sn-glycerol-3-phosphate transporter  19.76 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000087639  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0395  glycerol-3-phosphate transporter  22.07 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0536129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0385  glycerol-3-phosphate transporter  22.07 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000112087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  22.96 
 
 		 460 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3760  MFS family transporter  21.67 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>