59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2553 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2553  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  668    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000883615  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2952  hypothetical protein  49.23 
 
 
326 aa  320  3e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000861899  normal  0.0228884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2566  aminoglycoside phosphotransferase  26.18 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000137016  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0693  hypothetical protein  24.5 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2594  hypothetical protein  26.42 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11466e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0705  hypothetical protein  24.5 
 
 
323 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0604  hypothetical protein  24.9 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0637  hypothetical protein  24.9 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2773  hypothetical protein  25.17 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179164  decreased coverage  0.00000000008216 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0548  hypothetical protein  24.5 
 
 
323 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0548  hypothetical protein  24.9 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0550  aminoglycoside phosphotransferase  24.9 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4665  hypothetical protein  24.1 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  hitchhiker  5.6288599999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0672  hypothetical protein  24.5 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2405  hypothetical protein  26.09 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.129699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2581  hypothetical protein  26.09 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2591  hypothetical protein  24.41 
 
 
315 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0632128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0766  hypothetical protein  25.4 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2359  hypothetical protein  25.17 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000276789  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0305  aminoglycoside phosphotransferase  25 
 
 
338 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4439  aminoglycoside phosphotransferase  25.96 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.637315  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3016  aminoglycoside phosphotransferase  27.64 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0991  aminoglycoside phosphotransferase  25.81 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.129847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2123  aminoglycoside phosphotransferase  24.13 
 
 
322 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.153292  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0381  aminoglycoside phosphotransferase  23.81 
 
 
333 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3723  aminoglycoside phosphotransferase  22.84 
 
 
337 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00316324  normal  0.0533229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1690  homoserine kinase  24.42 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0135  hypothetical protein  25.98 
 
 
317 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1164  hypothetical protein  23.66 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1236  aminoglycoside phosphotransferase  24.81 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  hitchhiker  0.00362216 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1376  aminoglycoside phosphotransferase  22.45 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.332208  normal  0.0870793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0292  aminoglycoside phosphotransferase  21.65 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0260257  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0069  aminoglycoside phosphotransferase  24.07 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0546  homoserine kinase  23.64 
 
 
321 aa  57  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0997708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0191  aminoglycoside phosphotransferase  22.78 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0200  aminoglycoside phosphotransferase  22.78 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0180  aminoglycoside phosphotransferase  22.78 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.727463  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0285  aminoglycoside phosphotransferase  24.65 
 
 
352 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0442992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4355  aminoglycoside phosphotransferase  21.89 
 
 
347 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0612  homoserine kinase  25 
 
 
321 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.699859 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0652  homoserine kinase  24.42 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.252204  normal  0.14086 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3200  aminoglycoside phosphotransferase  24.07 
 
 
329 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2085  aminoglycoside phosphotransferase  19.69 
 
 
528 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85174  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3424  aminoglycoside phosphotransferase  29.63 
 
 
375 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5572  aminoglycoside phosphotransferase  23.72 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.851331  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1066  homoserine kinase  23.2 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0153497  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2438  homoserine kinase  22.77 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1793  aminoglycoside phosphotransferase  21.27 
 
 
336 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  27.22 
 
 
384 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6183  hypothetical protein  23.18 
 
 
346 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0171293  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2045  homoserine kinase  23 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.674394  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2325  aminoglycoside phosphotransferase, N-terminal region  25.58 
 
 
147 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0712052  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3476  Homoserine kinase  22.05 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3331  homoserine kinase  22.96 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4394  homoserine kinase  20.74 
 
 
320 aa  43.9  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3412  Homoserine kinase  22.05 
 
 
322 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0528  homoserine kinase  22.47 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0661  aminoglycoside phosphotransferase  19.57 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.818209 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5041  aminoglycoside phosphotransferase  21.34 
 
 
356 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>