35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1703 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1703  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  719    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1686  hypothetical protein  83.1 
 
 
359 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0479604  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1704  hypothetical protein  83.94 
 
 
359 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2811  hypothetical protein  48.6 
 
 
369 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.89144  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0259  putative 3-carboxymuconate cyclase  36.34 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6277  hypothetical protein  30.95 
 
 
382 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.853804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4891  hypothetical protein  27.54 
 
 
434 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5379  putative 3-carboxymuconate cyclase  27.79 
 
 
364 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  24.14 
 
 
372 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0905  Ig family protein  24.32 
 
 
3230 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  25.85 
 
 
3222 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  24.26 
 
 
353 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.51 
 
 
521 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  26.48 
 
 
331 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  26.01 
 
 
379 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  25.69 
 
 
331 aa  47  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  25.69 
 
 
331 aa  47  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  25.69 
 
 
331 aa  47  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  25.69 
 
 
331 aa  47  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  25.69 
 
 
331 aa  47  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  25.69 
 
 
331 aa  47  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.51 
 
 
522 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  25.9 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  24.51 
 
 
331 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  23.4 
 
 
368 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  24.24 
 
 
480 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  35.11 
 
 
381 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  26.17 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02790  conserved hypothetical protein  25.09 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  24.84 
 
 
331 aa  43.1  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  22.95 
 
 
411 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  22.95 
 
 
411 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  22.95 
 
 
391 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  22.95 
 
 
391 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3160  senescence marker protein-30 (SMP-30)  24.2 
 
 
289 aa  42.7  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>