225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1100 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  100 
 
 
340 aa  694    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  56.68 
 
 
344 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  52.35 
 
 
349 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  52.24 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  52.24 
 
 
349 aa  339  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  52.24 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  52.35 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  51.8 
 
 
349 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  52.24 
 
 
349 aa  339  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  51.94 
 
 
349 aa  339  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  51.94 
 
 
349 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  51.94 
 
 
349 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  51.18 
 
 
349 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  51.79 
 
 
343 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  51.79 
 
 
343 aa  332  5e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  48.97 
 
 
343 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  48.08 
 
 
345 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  47.76 
 
 
340 aa  296  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  41.86 
 
 
363 aa  268  8.999999999999999e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  40.95 
 
 
357 aa  253  3e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  39.7 
 
 
342 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  35.8 
 
 
399 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  37.73 
 
 
363 aa  222  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  35.8 
 
 
394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  35.78 
 
 
399 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  39.64 
 
 
372 aa  216  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  35.21 
 
 
371 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  34.53 
 
 
392 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  32.25 
 
 
353 aa  205  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  38.35 
 
 
402 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  36.5 
 
 
398 aa  202  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  35.5 
 
 
398 aa  202  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  36.39 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  35.21 
 
 
398 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  36.2 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  35.8 
 
 
394 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  35.8 
 
 
394 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  33.53 
 
 
387 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  36.22 
 
 
394 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  35.31 
 
 
396 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  34.72 
 
 
387 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  33.92 
 
 
405 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  33.53 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  32.94 
 
 
397 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1064  peptidase, putative, truncation  60.24 
 
 
86 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357611  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  27.88 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  31.96 
 
 
357 aa  94.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  26.99 
 
 
384 aa  93.6  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  28.28 
 
 
339 aa  90.5  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  26.89 
 
 
344 aa  89.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  25.78 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  27.05 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  24.84 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  26.61 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  25.15 
 
 
346 aa  83.2  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  25.51 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0546  hypothetical protein  27.96 
 
 
374 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0522  hypothetical protein  27.96 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  24.2 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  26.71 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  23.43 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  27.85 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  27.6 
 
 
362 aa  79.7  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  28.43 
 
 
350 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  26.59 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  27.7 
 
 
349 aa  77.8  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  25.54 
 
 
359 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  30.92 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  26.91 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  23.29 
 
 
362 aa  75.9  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1273  Cellulase  22.8 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.758281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2521  exoaminopeptidase  22.8 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  30.43 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1285  exoaminopeptidase  22.8 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2536  exoaminopeptidase  22.8 
 
 
345 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  26.38 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  26.26 
 
 
340 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1103  Glutamyl aminopeptidase  25.46 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24305 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  29.95 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  24.53 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2674  exoaminopeptidase  22.3 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02294  predicted peptidase  22.48 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02255  hypothetical protein  22.48 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3616  exoaminopeptidase  22.3 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  25.42 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  30.1 
 
 
349 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  24.01 
 
 
350 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  27.06 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2113  peptidase M42  25.89 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  27 
 
 
347 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  26.46 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  25.32 
 
 
354 aa  70.1  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  24.78 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1433  Cellulase  23.71 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0501  Glutamyl aminopeptidase  25.51 
 
 
355 aa  69.3  0.00000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00911075  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  25.16 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  27.06 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  22.19 
 
 
359 aa  68.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  24.13 
 
 
361 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  25.57 
 
 
361 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>