More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0299 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0299  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
342 aa  708    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1582  glycosyl transferase family 2  55.23 
 
 
314 aa  365  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1376  glycosyl transferase family protein  54.22 
 
 
309 aa  335  7.999999999999999e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0850607  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1446  glycosyl transferase, family 2  50.99 
 
 
308 aa  333  3e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1479  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.18 
 
 
308 aa  329  4e-89  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0018066  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1401  glycosyltransferase-like protein  48.17 
 
 
317 aa  315  5e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0170  glycosyltransferase-like protein  51.96 
 
 
310 aa  306  4.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000142505  hitchhiker  7.37395e-16 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2086  glycosyltransferase  50 
 
 
310 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.85266  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1700  glycosyltransferase-like protein  43.95 
 
 
324 aa  292  4e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  44.55 
 
 
312 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  44.86 
 
 
312 aa  287  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8842  glycosyl transferase family 2  42.21 
 
 
387 aa  278  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5555  bactoprenol glucosyl transferase  44.55 
 
 
312 aa  276  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  40.12 
 
 
367 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0744  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
327 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0728  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
327 aa  265  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  40.58 
 
 
319 aa  263  4e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 
347 aa  258  8e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  38.32 
 
 
320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  40.46 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 
358 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 
359 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
365 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
365 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  41.72 
 
 
340 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2778  glycosyl transferase family protein  40.13 
 
 
333 aa  248  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2611  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  38.94 
 
 
346 aa  248  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  41.31 
 
 
306 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
339 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  39.68 
 
 
383 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  37.15 
 
 
330 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  39.47 
 
 
335 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 
350 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  39.8 
 
 
365 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  39.27 
 
 
348 aa  247  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  39.37 
 
 
337 aa  247  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  42.3 
 
 
308 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  42.3 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 
330 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  42.3 
 
 
310 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1389  glycosyl transferase  40.85 
 
 
333 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.776961  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0363  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.35 
 
 
368 aa  245  8e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  42.26 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  42.3 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  42.62 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.53 
 
 
332 aa  243  3e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  39.02 
 
 
319 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
310 aa  243  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  42.3 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 
340 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 
332 aa  242  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  41.61 
 
 
373 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  41.61 
 
 
373 aa  242  7e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  40.46 
 
 
360 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.59 
 
 
323 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.59 
 
 
323 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  40.59 
 
 
323 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.59 
 
 
323 aa  241  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  40.59 
 
 
323 aa  241  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.87 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.87 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.87 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  40.2 
 
 
353 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  37.7 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  37.58 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  39.14 
 
 
342 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  35.24 
 
 
312 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  37.7 
 
 
331 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  39.93 
 
 
339 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  38 
 
 
330 aa  232  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  38.59 
 
 
312 aa  231  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  38.33 
 
 
330 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  37.09 
 
 
311 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  37.09 
 
 
311 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  37.73 
 
 
339 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 
319 aa  230  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  37.38 
 
 
334 aa  229  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  37.85 
 
 
338 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
335 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0350  glycosyl transferase family protein  36.73 
 
 
333 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.319839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
339 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  36.42 
 
 
341 aa  227  3e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  36.68 
 
 
319 aa  227  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  40.73 
 
 
309 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  37.99 
 
 
347 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  40.73 
 
 
309 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 
343 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  36.91 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2352  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 
363 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0302049  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  35.58 
 
 
343 aa  225  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  40.2 
 
 
347 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  43.46 
 
 
304 aa  225  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  39.27 
 
 
324 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  40.4 
 
 
309 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2576  glycosyl transferase family 2  37 
 
 
356 aa  223  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0526  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 
309 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0065  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 
312 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000100424  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11990  glycosyl transferase  40.46 
 
 
313 aa  222  6e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  39.2 
 
 
324 aa  222  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>