65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0028 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0043  tRNA-Gly  98.63 
 
 		 73 bp  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.530353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0034  tRNA-Gly  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0035  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 76 bp  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.801401  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0018  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 76 bp  131  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t23  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 76 bp  131  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0040  tRNA-Gly  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_757  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0984996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.453566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  89.09 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0015  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209319  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0044  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0032  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0021  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0024  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.854506  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  85.07 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0006  tRNA-Asp  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0058  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0002  tRNA-Asp  86.36 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0034  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1317  phenylacetic acid degradation-related protein  96.67 
 
 		 519 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0048  tRNA-Gly  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  84.38 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0046  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0004  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0025  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.157688  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0020  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286535 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2519  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00159808  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0036  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0848  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.473747  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0019  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000527729  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0010  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274853 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0050  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0044  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000615289  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0012  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000114825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0041  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297349  decreased coverage  0.00434413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0061  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2530  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137237  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2223  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000628537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2234  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000174827  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0001  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0654082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>