33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2046 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  100 
 
 		 117 aa  239  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  65.14 
 
 		 109 aa  155  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  60.95 
 
 		 106 aa  144  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  60.95 
 
 		 108 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  62.86 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  62.14 
 
 		 110 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  55.24 
 
 		 126 aa  124  5e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  38 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  38.3 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  37.14 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  32.76 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  55.56 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  34.86 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 307 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  34.88 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  35.16 
 
 		 119 aa  52  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  31.63 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0496  hypothetical protein  41.54 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0554271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  43.04 
 
 		 307 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  47.8  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1717  hypothetical protein  41.46 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  40.91 
 
 		 230 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  30.39 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  40.62 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  39.06 
 
 		 237 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  44.23 
 
 		 306 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  41.51 
 
 		 234 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  39.06 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>