20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1777 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.67 
 
 		 233 aa  157  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.49 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  35.16 
 
 		 230 aa  95.1  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  28.77 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.94 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  30.96 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  24.18 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  25.46 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  32.03 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  30 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  23.2 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1197 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>